脑是人体最重要，也是功能最复杂的器官，脑的工作原理至今没有被人类彻底认识。大脑皮层的形态不仅和智力有关，而且各种神经精神疾病有关。磁共振成像是基于核磁共振这一物理现象发展起来的，它能够将大脑内部的组织结构显示出来，具有安全、无创、全面、快速、准确、灵敏度高等特点，已经成为神经科学研究和医学诊断的主要工具。为了对磁共振图像数据进行有效定量的分析，首先对磁共振影像进行分割配准，然后在标准空间中提取出个体目标结构的特征信息，并对群体测量结果进行统计分析推断。统计分析的研究结果在神经科学、手术模拟和药物治疗评价等诸多研究与应用领域都有重要作用。　　可视化是利用人类大脑对视觉信息理解的强大能力探索海量复杂数据，以期帮助人们理解隐藏在数据之中的先前未知结构和信息。用人工的方式发现海量数据中微小的差异是极其困难并且消耗时间的;但是，如果同样的数据被转换为一副图像并且能够按颜色来编码的话，那么这种小的差异会立即变得明显。　　本文所做的工作围绕基于磁共振医学图像的大脑皮层结构研究，利用可视化软件包VTK和Tcl/Tk脚本语言，开发了三个可视化软件。按开发的先后顺序，第一个软件NetView用于显示大脑结构网络，它可以反映大脑皮层区域之间的连接关系;第二个软件MainView则关注于对磁共振医学图像切片的显示，可以用来分析原始的图像数据;第三个软件SurfaceVisual可以把对大脑皮层的统计分析结果映射到皮层表面上，用来观察比较统计分析结果。　　在软件开发的过程中，首先根据同一研究组中进行大脑医学图像分析研究的相关人员提出开发需求，然后根据需求设计软件的功能和图像用户界面，在开发过程中，参考了3DSlicer，BioImage Suite和MedINRIA等医学图像分析处理软件，并尝试使用了ITK，KWwidgets等软件包。最后开发的软件经过相关研究人员测试使用，并根据测试结果多次修改。