【摘 要】
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DRUG-Path,是一个基于子通路的综合性在线分析平台,用于分析和解释从生物学通路和任意类型基因或蛋白质高通量表达谱数据中推断出的药物作用机制、药物毒性作用机制和疾病发病
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DRUG-Path,是一个基于子通路的综合性在线分析平台,用于分析和解释从生物学通路和任意类型基因或蛋白质高通量表达谱数据中推断出的药物作用机制、药物毒性作用机制和疾病发病机制等。该平台针对生物学通路中的线性路径(即:子通路)作为药物作用的基本反应元件。这里定义的子通路是在任意一个给定的生物学通路中,从生物学上有意义的起始节点(膜受体或它们的配体)到终止节点(转录因子或它们的直接靶点)之间,蛋白质直接/间接相互作用或代谢反应,有序的线性的连接所形成的一条路径。
DRUG-Path在线工具不但提供了5个药物研究中常用的生物模型(人,小鼠,大鼠,狗,斑马鱼)所有的KEGG通路图打散后的子通路数据,而且还可以根据用户提供的药物相关表达谱数据,基于子通路策略,来识别药物应答子通路,提取药物应答主效子通路以及构建和分析药物应答主效网络。子通路数据和子通路分析得到的所有的结果都可以下载。我们用例子描述了DRUG-Path在线工具分析药物应答相关数据集,得到的生物学结果证明了该平台在解释药物作用机制方面的方便性及有效性,因而可以指导临床用药及新药研发。
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