改革开放以来,中国经济取得快速发展,中国也由传统农业大国转变为加工制造业为主的新兴发展中大国。2015年,中国在全球制造业总产值的占比已经达到1/4,成为“世界工厂”,但中国制造业依然处在全球分工和价值链的低端,制造业中主要以低技术、低附加值的劳动密集型产业为主导,技术密集型产业发展不足。推动高技术产业和战略性新兴产业的发展已经成为我国制造强国战略的重要内容。金融作为现代经济的核心,金融结构与经济结构相匹配将提高金融效率,促进经济增长,而中国金融结构却存在间接融资比重过大,直接融资发展不足、银行业市场集中度过高等结构问题。因此,需要制造业结构升级与金融结构优化相结合以促进中国经济结构转型。本文通过总结金融结构优化与制造业结构升级国内外的相关研究,通过模型推导与理论分析,并通过对金融结构优化、制造业结构升级现状研究,得出两者之间存在着互动关系。利用中国1999年到2015年的制造业结构、金融结构数据,使用VECM模型、格兰杰因果检验以及脉冲响应函数计量方法对两者互动关系进行实证检验,结果表明:融资结构、银行业市场结构与制造业结构之间存在长期均衡和短期波动关系,融资结构与制造业结构存在正相关关系,融资结构优化促进了制造业结构升级,制造业结构升级也促进了融资结构优化。银行业市场结构与制造业结构之间存在负相关关系,降低银行业存贷款集中度有利于制造业结构升级,制造业结构升级也降低了银行业存贷款集中度。另一方面,融资结构与制造业结构存在互为因果关系,银行业市场结构与制造业结构存在互为因果关系。最后依据理论分析与实证结果,提出金融结构优化促进制造业结构升级的对策建议。