我国笼养食蟹猴种群遗传多样性与亲子鉴定研究

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食蟹猴(Macaca Fascicularis)是实验灵长类动物中用量最大的物种,我国饲养种群全部来源于东南亚各国,却已经成为饲养实验食蟹猴最大的输出国。为了清晰掌握我国饲养食蟹猴种群的遗传结构、遗传谱系并提供有效的遗传监测方法,本文利用微卫星DNA和MHC基因连锁的微卫星作为分子标记,构建了快速便捷的复合扩增体系;并对我国饲养食蟹猴群体进行了系统的遗传学研究,得到以下研究结果:1.利用文献上和GenBank上的引物,本文将所选的24对微卫星DNA引物和6对MHC基因连锁的微卫星引物进行复合扩增体系构建,成功地构建了以6个微卫星座位为一个组合的复合扩增体系。并获得了对食蟹猴有效的、对检测数据无干扰的18个微卫星座位和6个MHC微卫星座位,为食蟹猴物种提供了快速便捷有效的遗传分析方法。2.微卫星DNA遗传分析表明,我国饲养食蟹猴种群具有较高的遗传多样性。其18个微卫星基因座的等位基因数为9-20,平均等位基因数为16.21,有效等位基因数为3.7497-13.5035,平均等位基因数为8.65;多态信息含量为0.6921-0.9679,平均多态信息含量为0.8631;观察杂合度在0.3548-0.8897,平均观察杂合度为0.6533;期望杂合度为0.7333-0.9259,平均期望杂合度为0.8656,观察杂合度与期望杂合度之间的最小差值为0.0254(D6S1691),最大差值为0.5711 (D22S280); Hardy-Weinberg平衡检验处于不平衡状态;基因流为2.2806-12.6265,其平均值为5.2992。3.MHC基因连锁的STR标记分析表明,所选的MHC基因连锁的STR在我国食蟹猴种群中具有较好的多态性。其6个基因座的等位基因数为4-22,平均等位基因数为15,有效等位基因数为2.5944-13.7317,平均等位基因数为6.9646;多态信息含量为0.5465-0.9225,平均为0.7620;观察杂合度在0.4142-0.9588,平均观察杂合度为0.7183;期望杂合度为0.6311-0.9272,平均期望杂合度为0.7867,观察杂合度与期望杂合度之间的最小差值为0.0035(D6S2741),最大差值为0.3489 (DQcar); Hardy-Weinberg平衡检验MICA与D6S2741两个位点处于平衡状态,其余4个位点不平衡;各位点的基因流为1.8145-9.2045,平均为4.2711。4.利用MHC基因连锁的STR标记分析食蟹猴与恒河猴之间的遗传差异。经过比较食蟹猴表观等位基因和有效等位基因均分别为15和6.9646,恒河猴等位基因和有效等位基因均分别为13和5.3922,即食蟹猴的等位基因数均比恒河猴多。食蟹猴的观察杂合度与期望杂合度分别为0.7183和0.7867,恒河猴的表观杂合度与期望杂合度分别为0.6712和0.7380,即食蟹猴的观察杂合度与期望杂合度之间的差值比恒河猴之间的少。食蟹猴的基因流为4.2711,恒河猴的基因流5.2949,食蟹猴的基因流比恒河猴的基因流小。5.18个STR位点的累积非父排除概率达99.9999%,10个STR位点的双亲RCP值达99.9999%,单亲RCP值达99.99969%,可以达到亲权鉴定的要求。
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