本文借鉴国内外有关农产品质量追溯的相关理论和实践经验，结合广西农垦企业农产品质量追溯系统的建立与应用实例，通过分析系统理论框架，根据其追溯流程、管理系统、物流系统、信息系统的的要求，提出广西农垦企业开展农产品质量追溯系统应建立与系统相适应的企业管理体系，规范产业链全程物流管理，建立信息系统，形成信息流和物流的同步传递，并对源头农场、茶业集团、立新农场、永新畜牧公司4个企业的开展柑桔、茶叶、猪肉产品质量追溯系统建设的实施情况和运行效果进行实例分析，认为农产品质量追溯项目的实施，将有助于提高企业标准化管理水平、职工质量安全意识、可追溯产品品牌影响力、效益和质量安全监管水平，满足政府管理部门、消费者的信息查询、农产品质量安全监管要求，并对地方农产品生产经营者建立质量追溯系统起到较好的辐射带动作用。同时也提出了企业在项目实施过程中存在农户认知不足、文化素质低和市场认可度不高的困难，农垦农产品质量追溯系统也存在软件服务瓶颈和推广应用面不广的缺陷，建议进一步健全农产品质量追溯相关的法律法规、简化系统定制流程和信息采集要求，建立一个普适性平台，降低门槛以吸纳更多的企业和农户参与其中。