作为益生菌产业中的重要研究内容,针对益生菌候选菌株筛选及鉴定方法的研究一直受到研究者们的关注。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法是近年发展起来的,基于菌株特征性蛋白指纹图谱实现菌株鉴定的新型微生物鉴定方法,其方法除具有鉴定准确、快速等优点外,还具备可高通量鉴定被检菌株等特点,其方法的适用性及实用性正被研究者们广泛而深入的研究。本文通过对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法检测及鉴定常见益生菌过程中不同的分析方式、不同的基质、不同的基质溶剂、不同的菌体处理溶剂、不同的点样方式及不同的点样比例等主要影响因素进行考察,首次建立了基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法检测及鉴定常见益生菌的最佳实验方法。另外,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法所得鉴定结果被证明具有较高的稳定性及较好的重复性且当菌落总数在104cfu向以上时被检菌株均能够被正确地鉴定到种水平。此外,以传统表型鉴定方法及16S rDNA序列同源性分析鉴定方法为对比方法,对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法检测及鉴定常见益生菌的实用性进行考察发现,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析法具备对常见益生菌在属、种、亚种及菌株水平上进行鉴定的能力且此方法鉴定准确、快速、操作简易、廉价、可对被检菌株进行高通量鉴定,展现出了此方法良好的应用前景。