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RNA聚合酶Ⅱ介导的真核基因转录过程,受多种表观遗传复合体的高度精细调控。这些复合体通常作为共激活或者共抑制因子,与序列特异性转录因子协同识别DNA上的转录起始元件,进而调节转录。在酿酒酵母中,Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶复合体（SAGA）曾被报道,作为一种通用的转录起始辅助因子,参与酵母细胞内至少10%的基因转录事件。最近的研究指出,SAGA复合体在酵母体内是一个更加通用的转录激活因子。酿酒酵母SAGA复合体由4个亚基、共计19个成员组成,分别是HAT（Gcn5,Ada2,Ada3,Sgf29）、DUB（Ubp8,Sgf11,Sgf73,Sus1）、TAF（Taf5,Taf6,Taf9,Taf10,Taf12）以及SPT（Tra1,Ada1,Spt3,Spt7,Spt8,Spt20）。其中两个相对独立的催化组分,Gcn5和Ubp8,允许SAGA复合体兼具H3乙酰化酶和H2B去泛素化酶活性;其活性的缺陷或者减弱,会影响RNA聚合酶Ⅱ介导的转录起始过程和延伸过程,导致基因转录效率降低。我们选取酵母SAGA复合体作为研究对象,通过优化样品的纯化过程,联合Gra Fix交联,成功地获取了足量的、生化性质均一的样品。借助先进的冷冻电镜技术,我们成功将该复合体整体结构的分辨率解析到6.9?,获得了一个连续性更好的密度;同时,将其中的Tra1组分解析到近原子分辨率（4.6?）。结果分析显示,我们发现了位于SAGA同侧的两个全新结构特征。为了鉴定和分析电镜结果,我们对酿酒酵母SAGA样品进行了化学交联-质谱联合分析;结合现有的数据,提出了一个改进的SAGA组装模型:把Spt8定位到R-right区域,而把Taf6定位到R-left区域。基于Tra1的表面电势分析,我们发现,在Tra1SAGA和Tra1Nu A4所暴露出来的、用于结合TFs和DNA的正电富集区域明显不同;同时考虑到两者完全不同的组织方式,我们推测SAGA与Nu A4在生理功能上可能由于元件共享或者置换而有所拮抗。最后,通过对接分析,我们提出了一个SAGA-Nucleosome相互作用模型:发现ub-Nucleosome-DUB复合体结构远离HAT区域;考虑到Lobe B同时容纳了Gcn5和Ubp8,我们认为SAGA介导的乙酰化和去泛素化两个过程,很可能不会同时发生在单个核小体上。以上结果也为SAGA结构和功能机制的进一步研究提供了更多线索。