用大规模测序技术对tRNA组进行高分辨率定量测定

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangchengwang0
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
tRNA是能携带氨基酸的小分子非编码RNA,不仅在蛋白质翻译过程中起着重要作用,在生物进化研究、疾病研究以及蛋白质的工业化生产中也有着很重要的理论意义和应用价值。tRNA组指的是t RNA的全体,因为tRNA分子种类众多、二级结构非常稳定、一级序列极为相近、理化性质相似、碱基高度修饰,使用传统的研究方法对每种tRNA进行定量测定存在着很大的困难。在本文中我们开发了一项基于大规模测序技术的tRNA组全定量研究方法,对tRNA组的测定能达到单碱基分辨率,将几十到几百种tRNA分辨开来。我们把这项技术应用于多种生物,测定在不同生理状态下的tRNA组变化。我们发现,在大肠杆菌氧化应激过程初期tRNA组呈现整体下调的趋势,在氧化应激过程后期tRNA组却呈现一个整体恢复的趋势,tRNA组的迅速下调与大肠杆菌应对氧化压力有关。原核或真核表达系统在表达异源蛋白过程中tRNA组呈现整体下调的趋势,这可能是一种类似于应对病毒入侵的细胞自我保护机制。小鼠不同组织间tRNA的表达存在组织特异性,且大部分预测出来的tRNA基因并不开放;此外tRNA基因的转录水平与其周围的mRNA无相关性,提示着t RNA有独立的转录调控体系,并与表观遗传调控关系不大。综上所述,我们开发的基于二代测序的tRNA组研究方法能为tRNA组以及蛋白翻译延伸调控的研究提供一个更为直接的、高精度的实验技术手段。
其他文献
目的:探讨CRMP4是否能与微丝发生相互作用并明确结合部位,以及如何影响神经元的轴突、树突及树突棘发育。方法:首先构建GST-CRMP4及其截短片段原核质粒,然后进行体外表达其融
本论文的主要目的是给出Rota-Baxter超代数的定义,并运用Rota-Baxter超代数构造出pre李超代数、dendriform超代数及Leibniz Poisson超代数等代数.特别的,本文还研究了RotaBax
随着工业化和城市化的快速发展,海洋污染导致的赤潮灾害成为世界性的难题。球形棕囊藻在我国珠江口海域频繁引发赤潮,对海洋生态环境和人类健康造成了严重的影响。化学和物理
细胞膜表面的粘附受体分子对细胞感知和集成细胞周围微环境所提供的信号,例如基底表面物理化学性质和基底硬度等至关重要,细胞将所感知的化学信号或力信号转化为相应的生物信
在本文中,我们首先研究了n-李代数的模糊子代数及模糊理想,并且得到n-李代数的子代数的特征函数就是模糊子代数.进而研究了模糊子代数及模糊理想的一些性质.接着,我们对模糊
本文通过对径向基函数插值、Multi-Quadric拟插值的研究,对已有的拟插值算子LAf(x)、LBf(x)、LCf(x)和LDf(x)进行了分析,文中验证了它们的线性再生性、保单调性和保凸性,并给
在国家“十二五”规划鼓励社会资本进入医疗服务领域及新医改计划逐步取消医院的药品加成等多重因素的驱动下,市场对医疗器械设备的需求加大,医院对医疗器械的投资逐渐增加。
Anti de Sitter空间(简称Ad S-空间)是具有负的常截面曲率的Lorentzian空间型,在相对论中,Ad S-空间是Einstein方程的真空解之一,且具有正的能量表示,是理论物理学中一个很重
目的:B类G蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptor,GPCR)PAC1是垂体腺苷酸环化酶激活肽(pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide,PACAP)的特异性受体,其高表
由于部分线性模型包含参数和非参数两个部分,因此综合了一般的线性回归模型和非线性回归模型的优点,同时也克服了它们的一些局限性。由于部分线性EV模型在经济学、测量学等众