紫薇微卫星标记开发及矮化性状的分子标记

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紫薇(Lagerstroemia)隶属千屈菜科紫薇属,花期长达3个月,花色丰富,是我国夏季重要的观赏花木。通过传统杂交育种,已培育出枝叶微小、节间缩短的低矮型紫薇品种。目前,人们对紫薇矮化性状的形成机制尚不了解。为了探讨紫薇株型的遗传规律,本文利用磁珠富集法开发了一批SSR标记,对收集的紫薇种质资源进行遗传多样性分析,构建紫薇株型分离群体,对紫薇矮生性状遗传规律进行了初步探讨。主要结论如下:(1)构建了紫薇的微卫星富集文库,成功测序155个阳性克隆,得到64条含SSR位点序列及74个SSR位点,设计54条引物进行筛选,共有20对引物可有效扩增。利用10个品种对20对引物进行多态性检测,共得到11对多态性较高的引物,可在紫薇近缘种中有效扩增,通用性较好。(2)利用自主开发的11对SSR引物及已公开发表的30对多态性较高的SSR引物对43个紫薇品种和5个紫薇原种进行了遗传多样性的评价。共得到317个SSR等位位点,平均每一标记等位位点数(A)为7.7317个。多态信息量(PIC)的平均值为0.5881,变化范围0.8567-0.209。Shannon多样性指数(I)的变化范围为0.5061(SSR21)~2.2835(SSR3),平均值为1.3525。Nei’s指数即基因多样性指数的变化范围是0.2159(SSR21)~0.8687(SSR3)。观察杂合度(Ho)最高为0.7917(SSR17),最低为0.0851(SSR21);期望杂合度(He)的变化范围是0.2183(SSR21)~0.8798(SSR6)。F指数(Fis、Fit和Fst)分别为0.1548,0.2041,和0.0583,表明亚群体遗传差异程度不高。种质间遗传距离变异范围为0.1585-0.9125之间,平均值为0.5972,聚类结果将48份资源分为4个群组,每个聚类群又包括不同的亚群,聚类结果基本和种质遗传背景相符。从41对多态性引物中筛选出10对核心引物,绘制了35个国外引进品种的SSR指纹图谱。(3)选用屋久岛紫薇(L. fauriei)为母本、紫薇品种’Pocomoke’(L. indica ’Poco moke’)为父本杂交获得的F1群体,根据不同株高将群体分为矮生型和普通型。对分离比进行遗传分析和X2检验,结果表明紫薇矮生性状受一对完全显性主效基因控制,同时存在微效修饰基因。以F,群体为试材,采用集团分离分析法构建普通型/矮生型基因池,从28对AFLP引物及41对SSR引物中筛选出与控制紫薇矮生性状基因相连锁的分子标记M53E39-92,经重复性验证和群体单株验证,该标记与矮化基因遗传距离23.33cM。
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