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猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratorysyndrome virus, PRRSV）引起的以母猪流产、死胎、木乃伊胎等，断奶仔猪呼吸道症状等为特征的一种猪传染病。自1996年中国首次发现PRRSV，特别是2006年高致病性PRRSV出现以来，PRRS给我国养猪业造成了巨大的经济损失。PRRSV基因组易变异的特性会导致该病毒某些生物学特性改变，从而增加对该病的控制难度。本研究旨在通过对河南地区PRRSV分子流行病学调查、两株新变异毒株的重组分析以及流行毒株的分离鉴定，了解河南地区PRRSV流行情况，为河南地区PRRS的防控提供了参考依据。1.2012-2013年河南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查收集54份疑似病料中17份检测为阳性，阳性率为31.5％；通过对阳性样品的ORF5全基因和NSP2部分基因序列进行遗传进化分析发现，河南地区流行毒株主要为美洲型PRRSV，且17份阳性样品中10份与高致病猪繁殖与呼吸综合征病毒（HP-PRRSV）高度同源、2份与经典PRRSV高度同源、另外5份与美洲流行毒株NADC30高度同源，尤其是该类毒株的NSP2基因在不同部位存在393个核苷酸缺失，中国尚未见相关报道，是一类国内新出现的变异毒株。本研究结果表明，2012-2013年河南地区PRRSV主要流行毒株为HP-PRRSV，同时出现了新变异毒株，使河南地区乃至我国PRRSV变异种类更加多样化，提示加强PRRSV流行及变异的监测十分必要。2. PRRSV河南新变异毒株HENAN-XINX株与HENAN-HEB株全基因序列分析为进一步了解河南新变异毒株HENAN-XINX株与HENAN-HEB株遗传变异情况，根据Genbank上公布的与其亲缘关系较近的毒株的全基因序列设计引物，对2株河南新变异毒株进行全基因扩增与序列比对和遗传进化分析，并利用基因重组分析软件进行病毒的重组分析。结果显示，河南新变异毒株HENAN-XINX株、HENAN-HEB株与国内HP-PRRSV和经典毒株亲缘关系在整个基因组上相差比较远，而与国外流行毒株NADC30的亲缘关系最近，说明2株流行毒株为国内新出现的变异毒株。基因重组分析显示，新变异毒株HENAN-XINX很可能是国内流行毒株S1株和NADC30株的基因重组毒株，而新变异毒株HENAN-HEB很可能是国内流行毒株09JS株和NADC30株的基因重组毒株。由此表明，新变异毒株不仅在我国出现，还发生重组事件，该毒株有可能通过重组，迅速适应我国PRRSV的生存环境，应该给予高度关注。3. PRRSV河南流行株的分离与鉴定将检测的PRRSV阳性病料经常规处理后接种到Marc-145细胞株上，连续传代，并利用RT-PCR方法和间接免疫荧光试验对其进行鉴定，结果在17份阳性样品中分离到3株PRRSV。本试验为研究PRRSV致病性，发病机理等提供可靠的实验材料，丰富了PRRSV流行病学数据库。