甘蓝型油菜SSR分子标记图谱构建和油酸含量QTL定位

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 22次 | 上传用户:n131421d
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脂肪酸组成是油菜等油料作物的重要品质指标。菜籽油含有的几种主要脂肪酸中,油酸是一种具有多种优势的脂肪酸。因此在传统油菜实现低芥酸化后,高油酸育种便成为了油菜脂肪酸组成改良的重要育种目标。进行油酸含量QTL定位以及对控制油菜油酸含量的主要基因FAD2基因进行研究,可以为探明油菜种子的油酸合成的相关分子机理和油菜高油酸育种提供重要理论基础。本研究利用无芥酸高油酸亲本“HOP”和无芥酸低油酸亲本“湘油15”杂交,构建了F2代分离群体,并以此为基础构建甘蓝型油菜(Brassica napus L.) SSR分子标记遗传图谱,在此图谱上进行油酸含量QTL定位,并初步研究了FAD2基因家族在油菜基因组中的分布情况及其与油酸含量的关系。本研究所完成的工作和取得的结果主要有:(1)甘蓝型油菜研究群体构建本研究以甘蓝型无芥酸高油酸油菜“HOP”和甘蓝型无芥酸低油酸油菜“湘油15”为亲本,构建了3个群体:①用于甘蓝型油菜遗传图谱构建的189株F2作图群体;②以“湘油15”为轮回亲本构建的BC4F1代群体,用于构建油酸含量近等基因系;③384个株系的F5代,用于构建重组自交系群体。(2)甘蓝型油菜遗传图谱构建以189株F2群体为作图群体,构建了1张包含342个SSR标记位点的甘蓝型油菜遗传图谱,图谱总长1697.1 cM,平均每个连锁群89.32 cM,标记平均间距6.35 cM。比较作图发现该图谱与参考图谱有较一致的共线性关系。偏分离标记分析发现该图谱偏分离标记的分布存在规律性:①总体略微偏向于亲本“湘油15”基因型;②成簇集中分布并趋向连锁群末端;③偏向类型相同的集中分布,单个分布的标记偏向于F,。(3)甘蓝型油菜F2群体脂肪酸含量分析用半粒法和单株法两种测定方式对F2作图群体进行了脂肪酸含量气相色谱分析。这两种测定方法之间存在显著的相关性,二者可以成为相互验证的脂肪酸含量检测手段。分析显示,除半粒法测定的硬脂酸含量与棕榈酸含量、油酸含量与硬脂酸含量的相关性不显著外,其他所有用半粒法和单株法所得脂肪酸含量之间都呈现显著相关;除棕榈酸和硬脂酸外,F2群体其它脂肪酸含量分布呈明显的正态分布,说明这些脂肪酸为多基因控制的数量性状;各种脂肪酸的遗传力很高,表明甘蓝型油菜脂肪酸含量主要受到遗传因素控制;遗传力与F1的脂肪酸组成呈显著正相关,说明非遗传因素对脂肪酸含量表型方差影响的绝对量相近,但因含量不同而至权重不同。(4)甘蓝型油菜油酸含量QTL定位用构建的SSR标记遗传图谱,用189粒半粒法测定油酸含量值和156株单株法测定油酸含量值进行甘蓝型油菜油酸含量QTL定位。在A5和C5连锁群分别发现1个油酸含量主效QTL,分别影响油菜籽中油酸含量约59%和16%(半粒法,CIM)的变异度。位于A5连锁群的QTL与FAD2基因有关;位于C5连锁群的QTL为新发现的油酸含量主效QTL,也可能与FAD2基因有关。(5)甘蓝型油菜基因组FAD2基因家族分析克隆并比较分析了“HOP”和“湘油15”的FAD2基因编码区和约1000 bp的上游调控区域。根据编码区可以将甘蓝型油菜FAD2基因家族分为FAD2-1a、FAD2-1b、FAD2-2和FAD2-34个拷贝。开放阅读框(OFR)分析显示除FAD2-3基因外,其它3个拷贝都能翻译出完整的包含384个氨基酸残基的油菜FAD2肽链。这3个拷贝中,无论是根据编码区还是上游调控区域,FAD2-1a与FAD2-1b之间亲缘关系较近,FAD2-2与这二者之间在编码区只有约89%的同源性,在调控区只有50%的同源性。通过与本研究测序获得的甘蓝FAD2-1基因序列、公共数据库白菜FAD2-1基因序列比较以及在公共数据进行的BLAST比对发现,FAD2-1b基因位于油菜A5染色体,FAD2-1a基因分布在C5染色体,FAD2-2基因分布在C1染色体。
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