我国的审计市场尚在不断发展阶段，审计收费制度不够完善，已有的部分研究已经揭示了可以影响审计收费的因素，在逐步揭开审计收费之谜。审计收费会关注上市公司的公司规模、治理结构等相关信息，而内部控制缺陷信息是否会影响审计收费的具体水平，以及以怎样的关系来影响审计收费水平，也需要相关研究去验证。本文阅读了国内外关于内控缺陷定义及分类的相关文献、关于审计收费的影响因素的相关文献，以及内控缺陷对审计收费的具体影响关系的相关文献。通过整理和分析这些文献，去了解二者的影响关系，同时确定本文的研究模型，并且确定模型中使用的自变量、因变量和控制变量。选择在深圳证券交易所上市的上市公司作为探索内控缺陷对审计收费影响关系的样本数据，探讨内控缺陷信息对审计收费的具体影响关系、重大缺陷信息对审计收费的具体影响关系两大问题。通过统计分析各变量的特征，对样本进行独立样本检验，对模型进行实证检验，最终得出以下两个结论：第一，相比于没有对外披露内控缺陷信息的上市公司支出的审计费用，对外披露了内控缺陷信息的上市公司支出的审计费用相对更高一些；第二，选取已经公布了内控缺陷的公司为样本数据，进行实证研究发现，相比于没有对外公布内控重大缺陷信息的上市公司的审计费用，对外公布了内控重大缺陷的上市公司，其支出的审计费用相对来说还要高一些。以上两个研究结论说明内控缺陷信息确实会影响审计收费的支出水平。本文的研究分为两部分，层次清晰，研究较为系统全面。并且，自2012年开始，我国要求所有上市公司必须披露内控信息，这为本文研究内控缺陷提供了更加完整可靠的信息和数据。本文的研究可以验证现代风险导向审计的实践情况。内控缺陷信息的存在预示着一定的控制风险，控制风险一旦增加，对于会计师事务所而言，检查风险则应该降低，这需要事务所付出更多的审计成本，并面临更大的风险。因此，事务所会关注客户公司的内部控制的相关信息。而对于接受审计服务的上市公司而言，上市公司为了减少审计费用支出，会更加注重企业内部控制的构建与有效实施。这对于我国审计工作的发展和上市公司内控工作的发展，都具有深刻的现实意义。