本文采用后结构主义视角下的话语分析，完整考察了2013年9月至2014年7月“天涯社区”围绕方舟子与崔永元关于转基因的论战（即网上所称“方崔大战”）的公共话语表达，从话语核心、话语结构及话语策略三个方面分析其中承载的民间社会的情绪与利益诉求，厘清争论乱象;再在更广泛的社会文化语境下阐释这一系列话语表达实践，探索隐藏在其中的权力抵抗;由此把握面对触及公共利益的公共议题时我国公众的参与状态，以及风险沟通的基本面相。　　研究发现，公众在科学话语、安全话语、权利话语、阶级话语、道德话语等不同话语类型交织杂糅的话语结构下探讨转基因及转基因食品问题，不同的话语类别遵循不同的话语逻辑结构，采取相异的叙事策略。而话语逻辑和叙事策略的冲突压缩了理性探讨的空间，同时也导致共识达成艰难。这一现象的根本原因在于话语表达者之间缺乏共通意义空间，基本科学知识、价值观、对科学及对权威的态度存在较大差异。尽管如此，这一系列话语实践仍是公众参与公共议题讨论的重要途径和方式。此外，公众并非全然被动、无知的存在，他们多样化的话语表达中有完整的参与逻辑，同时也有对公众行为、科学伦理、媒体道德、政府责任等重大社会问题的反思及建议。在公共领域中开展此类讨论，对于培育公众理性，推动公众参与，促进健康的传播环境与舆论生态的建设，都具有积极意义。