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番茄(Lycopersicon esculentum Miller)是世界上重要的蔬菜作物之一,因连年种植同一作物造成严重的连作障碍,番茄病害十分严重。本试验对课题组多年培育的56份番茄自交系材料进行番茄7种病害的9个抗性基因的分子标记检测,结合田间经济性状观测,选择优良自交系配制春茬、秋茬杂交组合试验,对杂交组合的植物学性状及果实品质进行主成分分析,根据主成分综合得分,筛选出3个春茬优良组合和3个秋季优良组合,并构建了秋茬3个优良组合的ISSR DNA指纹图谱。试验结果为后期筛选适宜我区种植的抗病番茄提供技术支持。主要试验结果如下：1、56份材料中,含烟草花叶病毒病抗性基因Tm-2a的材料33份。含抗黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-1的纯合材料4份,杂合7份；1份材料含杂合抗性基因Ty-2；含抗性基因Ty-3的纯合材料5份,杂合7份。在真菌性病害方面,含叶霉病抗性基因Cf-9的材料最多,有50份；含晚疫病抗性基因Ph-3的纯合材料1份,杂合6份；含枯萎病抗性基因I-2的32份；含黄萎病抗性基因Ve-2的纯合材料1份,杂合4份。材料中含根结线虫病抗性基因Mi-1的16份。2、对春茬的27个杂交组合的25个性状进行观测统计,不同性状在不同组合间差异较大,运用主成分分析将25个性状分成了5个主成分,根据主成分综合得分,筛选出C27、C12、C22共3个优良组合。对秋茬22个杂交组合的28个性状的观测,可知组合间性状变异系数较大,运用主成分分析将28性状分成6个主成分,根据主成分综合得分,筛选出Q15、Q1、Q4共3个田问抗黄化曲叶病毒病的优良组合。3、从100条ISSR引物中筛选出UBC-11、UBC-16、UBC-34共3条重复性好、多态性高的引物,对Q15、Q4、Q1组合及其亲本共扩增出17条清晰稳定的条带,其中多态性条带12条,多态率为70.59%。UBC-11、UBC-16及UBC-34三条引物单独使用能区分组合Q4、Q1及其亲本；单独使用引物UBC-34及UBC-11、UBC-16两条引物结合能区分Q15及其亲本。