ETV4转录调控DNA复制体中关键基因表达促进非小细胞肺癌细胞增殖与生长的机制研究

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目的:ETV4为ETS转录因子家族中PEA3亚家族的成员之一,调控诸多基因表达,参与胚胎肺发育、肿瘤发生发展以及糖尿病等过程。课题组前期结果表明,ETV4作为重要癌基因,其高表达与非小细胞肺癌(Non-small-cell lung cancer,NSCLC)患者的进展及不良预后相关。为进一步揭示ETV4在NSCLC中的调控机制,我们利用m RNA表达谱芯片检测了敲低ETV4对NSCLC细胞基因表达的影响。芯片结果表明,伴随ETV4敲低后下调的基因参与细胞周期进展、DNA复制、WNT、MAPK等重要信号通路的调控过程。本研究主要围绕ETV4对DNA复制关键基因(MCM2、MCM4、MCM5、MCM10和ORC1)表达的调控作用,探讨ETV4-DNA复制在NSCLC细胞增殖与生长中的作用机制。方法:1.细胞培养:含1%青霉素/链霉素的双抗及10%胎牛血清的RPMI-1640培养基培养贴壁生长的A549、H1299、H1703和H358细胞;H358T细胞是对H358细胞用TGF-β长期刺激后转化形成,相对H358细胞ETV4呈高表达。2.细胞转染:利用si RNA瞬时转染H1299、H1703、H358T细胞敲低ETV4表达;利用sh-ETV4慢病毒感染A549细胞,筛选获得稳定敲低ETV4细胞(A549-sh ETV4);H358细胞中ETV4表达量比较低,用于筛选获得稳定过表达ETV4细胞(H358-ETV4)。3.表达谱芯片检测:H1299、H1703及H358T细胞转染NC-si RNA或si-ETV4后进行芯片检测,由上海康城公司提供服务。4.qRT-PCR方法:检测ETV4-复制相关基因在m RNA水平的表达。5.Western-blot方法:检测ETV4-复制相关基因在蛋白水平的表达。6.染色质结合蛋白分离:分离获得与染色质结合蛋白质,并结合Western-blot方法分析ETV4对染色质结合状态复制相关基因表达的影响。7.报告基因构建与双荧光素酶检测:分析ETV4对复制相关基因启动子区的调控作用。8.染色质免疫共沉淀(Chip)方法:分析ETV4在基因启动子区的结合情况。9.Ed U掺入:检测ETV4对NSCLC细胞复制的影响。10.流式细胞术(FCM)检测:观察ETV4对NSCLC细胞周期分布的影响。11.皮下荷瘤实验:观察过表达ETV4对裸鼠移植瘤形成的影响。12.统计分析:数据以平均±标准差(SD)表示,使用Graph Pad Prism软件对实验数据进行t检验、单因素方差分析(ANOVA)和双因素差分析。SPSS13.0统计软件对实验数据应用卡方检验方法分析。P<0.05时认为有统计学意义。结果:1.表达谱芯片检测敲低ETV4对NSCLC细胞基因表达的影响KEGG生物信息学分析表明,伴随ETV4敲低而显著下调的基因主要参与:细胞周期分布、WNT信号通路、癌症通路、HTLV-I感染、精氨酸和脯氨酸代谢、DNA复制、MAPK信号通路、嘧啶代谢、肝细胞癌和嘌呤代谢途径。其中包括ANAPC11、BUB1、CCND2、CDC20、CDC25B、ESPL1、GADD45A、MCM2、MCM4、MCM5、ORC1、SMAD4和TFDP1在内的13个基因在细胞周期通路中富集,同时MCM2、MCM4、MCM5、ORC1四个基因包括在DNA复制过程。此外,MCM10在敲低ETV4后显著降低(FC=3.27,p=0.012)。因此,本研究中我们主要关注ETV4对5个复制相关基因—MCM2、MCM4、MCM5、MCM10以及ORC1的调控作用。2.ETV4对NSCLC细胞MCM2/4/5/10及ORC1基因表达的影响分别在过表达或敲低ETV4后检测了对NSCLC细胞中上述五个基因表达的影响。q RT-PCR结果表明,与对照组相比,H1703、H1299和H358T细胞si-ETV4转染组中MCM2、MCM4、MCM5、MCM10以及ORC1基因在m RNA水平的表达均显著降低(P<0.05)。反之,H358过表达ETV4(H358-ETV4)细胞中,上述基因在m RNA水平表达显著高于对照组(P<0.05)。此外,Western-blot结果表明,敲低ETV4显著抑制MCM2/4/5/10及ORC1蛋白表达,过表达ETV4后显著增加上述基因在蛋白水平的表达。3.ETV4转录水平调控MCMs和ORC1基因表达为了验证ETV4是否从转录水平调控上述基因表达,我们进一步通过构建报告基因、双荧光素酶检测以及染色质免疫共沉淀方法进行分析。双荧光素酶检测结果表明,与对照组相比,ETV4质粒与Luc-MCMS/ORC1报告基因载体共转染H358或HEK293T细胞后,可显著增加MCM2、MCM4、MCM5、MCM10以及ORC1基因启动子活性(P<0.001)。此外,在H358-ETV4细胞中,利用anti-flag抗体通过Chip-PCR方法检测发现,外源性ETV4(flag标签)与MCMS/ORC1基因启动子区结合。进一步在H1299细胞中,利用anti-ETV4抗体Chip-PCR方法检测结果证实,内源性ETV4可以与MCMs和ORC1的启动子相互作用。以上结果表明,ETV4在转录水平调控MCM2、MCM4、MCM5、MCM10和ORC1基因表达。4.ETV4对NSCLC细胞DNA复制的影响H1703、H1299和H358T细胞中转染si-ETV4,利用Ed U(5-Ethynyl-2’-deoxyuridine)标记方法检测细胞复制能力。Ed U掺入实验表明,敲低ETV4后Ed U掺入比例显著低于对照组细胞(P<0.05)。而在稳定过表达ETV4的H358-ETV4细胞中,Ed U掺入比例显著增高(P<0.01)。5.ETV4对NSCLC细胞MCMs和ORC1染色质结合蛋白的影响通过核浆分离、染色质结合蛋白提取以及Western-blot方法,在A549-sh ETV4细胞和H358-ETV4细胞中检测ETV4对MCMs和ORC1蛋白染色质结合的影响。结果表明,在稳定敲低ETV4的A549-sh ETV4细胞中,与染色质结合的MCMs和ORC1蛋白表达水平明显降低。反之,稳定过表达ETV4的H358-ETV4细胞中,染色质结合MCMs和ORC1蛋白水平明显高于对照组细胞。6.ETV4对NSCLC细胞周期进展的影响H1703、H1299和H358T细胞中转染si-ETV4后,应用流式细胞术检测敲低ETV4对细胞周期的影响。结果表明,敲低ETV4后,三个NSCLC细胞中G0/G1期的细胞比例显著增加(P<0.05),提示敲低ETV4后引起细胞G0/G1期阻滞。7.ETV4对裸鼠移植瘤生长的影响在体外检测基础上,进一步通过裸鼠荷瘤实验观察ETV4对肿瘤生长的影响。肿瘤生长曲线表明,H358-ETV4细胞接种组小鼠在12天左右出现肿瘤,并且肿瘤生长速度明显快于对照组(P<0.001)。至21天取材后发现,H358-ETV4组小鼠移植瘤在重量(P<0.001)和体积(P<0.001)上均明显大于对照组小鼠。结论:1.转录因子ETV4可影响细胞周期进展、DNA复制等多个重要信号通路中相关基因的表达,参与非小细胞肺癌的进展过程。2.ETV4转录调控DNA复制体中关键基因—MCM2、MCM4、MCM5、MCM10和ORC1表达,影响MCMs/ORC1染色质结合蛋白水平,从而调控非小细胞肺癌细胞的复制过程。3.ETV4调控细胞复制能力,影响细胞周期进展,是其促进非小细胞肺癌细胞增殖与生长的重要机制之一。
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