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研究目的:调查2015-2016年冬春季鄱阳湖地区活禽市场、家禽散养户/养殖场和候鸟栖息地环境中禽流感病毒的流行情况,分析检测到的禽流感病毒基因多样性和来源,揭示禽流感病毒在活禽市场、家禽散养户/养殖场和候鸟栖息地之间的流动,评估该地区新型禽流感病毒出现的风险,为禽流感病毒生态学研究提供基础研究数据。研究方法:在鄱阳湖地区活禽市场、家禽散养户/养殖场和候鸟栖息地环境中收集标本,使用SPF鸡胚进行病毒分离,使用Real-Time RT-PCR鉴定病毒,进而利用深度测序技术获得病毒全基因组序列,随后重点对主要HA亚型、NA亚型和NS基因分别进行序列突变位点分析和系统进化分析,进一步分析病毒的起源和进化。主要结果:(1)2015-2016年冬春季,在鄱阳湖地区监测中发现了 23种亚型的禽流感病毒。其中在活禽市场和家禽散养户/养殖场中分离到了 1100株禽流感病毒,检测到22种亚型的禽流感病毒,其中H1N3、H2N3和H4N3亚型禽流感病毒是在鄱阳湖地区首次发现,H12N2亚型禽流感病毒是在中国首次发现。在家禽养殖场环境标本中发现了 H7N9亚型病毒。在候鸟栖息地环境标本中检出了 7株病毒,包括H1N1、H3N2/N6、H5N1和H5N6亚型病毒。(2)候鸟-家禽养殖场-活禽市场之间,尤其是家禽养殖场-活禽市场环境之间存在基因流动现象,并发现一些禽流感病毒如H1N3、H2N3、H6N2、H6N5、H10N3和H12N2亚型禽流感首次进入到该地区的家禽环境中。(3)在该年度家禽中流行的禽流感病毒中,含有A等位基因和B等位基因NS片段的禽流感病毒同时流行,B等位基因所占比例低。(4)在H5N1、H5N2、H5N6、H7N9和H9N2病毒的M2蛋白中发现了金刚烷胺耐药性突变,在H3N6、H4N6、H5N6、H6N6、H7N3和H7N9病毒的NA蛋白上发现了NA功能性位点的突变,其生物学表型有待进一步验证。结论:2015-2016年度,鄱阳湖地区家禽养殖场和活禽市场环境被禽流感病毒污染的情况较为严重,高于既往监测年度。在鄱阳湖地区的活禽市场,家禽散养户/养殖场以及候鸟栖息地环境中的禽流感病毒监测中发现了 23种亚型的禽流感病毒,分离的多株低致病性禽流感病毒与东亚-澳大利亚迁徙路线上候鸟或者家禽中流行的禽流感病毒较为接近。而且禽流感病毒在活禽市场与家禽散养户/养殖场之间、在家禽环境与候鸟环境之间存在流动。在该地区的家禽养殖场环境中发现了 H5N6亚型和H7N9亚型禽流感病毒,因此需要在该地区持续开展禽流感病毒监测,为人感染禽流感病毒提供风险预警,并促进家禽生产中的生物安全措施的升级提供支持。同时,在多种亚型的禽流感病毒中发现了禽流感病毒的跨区域与和跨国传播,因此需要在禽流感病毒的监测和预防方面加强国际合作。