重组日本七鳃鳗TCTP的生物信息学分析,组织表达及活性初探

来源 :辽宁师范大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:liu605199097
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
翻译控制肿瘤蛋白(Translationally Controlled Turnor Protein,TCTP)属于一种高度保守并且大量表达的真核蛋白家族。其表达受转录和翻译水平的调节。TCTP具有多种生物学功能,例如影响细胞生长,细胞周期,恶性转化,细胞的抗逆性,凋亡。另外,在细胞外起到细胞因子的作用,参与许多免疫反应。   本项课题根据日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺cDNA文库中cDNA序列和部分EST预测功能基因片段,得到一条能够翻译TCTP模体的开放阅读框,根据序列特异性和酶切位点设计特异性引物,调取全长基因,进行基因克隆,并将其原核表达,亲和层析纯化后得到蛋白纯品。对此蛋白进行了生物信息学分析,并研究了它在七鳃鳗其他组织中的表达情况,最后细胞外活性实验表明它有促进组胺释放及促凋亡功能。   首先对日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺cDNA文库中1323条有效EST序列进行分析,得到一条能够翻译TCTP模体的开放阅读框,设计引物,以日本七鳃鳗口腔腺总RNA为模板进行RT-PCR,得长为519bp的目的基因,克隆至pET23b表达载体上,再转化至克隆菌DH5a后进行阳性转化子的筛选,然后将带有组氨酸标签的重组蛋白在E.coli BL21中进行了可溶性表达,经组氨酸亲和层析柱纯化后,获取分子量为22.4kD,浓度约为1.5mg/mL的TCTP纯品,将其命名为rLj-TCTP(recombinant Lampetra japonica TCTP)。   采用生物信息学的方法和工具对rLj-TCTP相应的氨基酸序列的理化性质、结构特征、功能及系统演化关系等进行预测和分析,以期为该蛋白的进一步研究提供一定的理论依据。   我们运用了RT-PCR的方法检测不同组织(心脏,肾,肠,腮,肌肉,肝脏,红细胞,白细胞)的特异性表达情况。结果表明该基因在各组织中都是不可或缺的重要基因。TCTP表达的稳定性表明其可能在细胞的生命周期中行使极其重要的生物学功能。   采用大鼠腹腔肥大细胞评价rLj-TCTP的组胺释放因子的活性将以梯度浓度(0.2ml/ml,lug/ml,5ug/ml,10ug/ml,50ug/ml,100ug/ml)与大鼠腹腔肥大细胞孵育,用荧光测定法测定组胺含量。结果表明,rLj-TCTP能够刺激大鼠腹腔肥大细胞释放组胺,并且呈剂量依赖性。由此可以推测,组胺作为一种免疫介质,七鳃鳗可以通过rLj-TCTP蛋白使宿主产生免疫反应,组胺还能够引起血管扩张效应,增强局部血流;另一方面,组胺还能增强血管内皮细胞表面凝血酶调节素TM的表达,凝血酶与凝血酶调节素结合,可降低凝血酶的活性,同时活化蛋白C,活化的蛋白C能够水解凝血因子Va和VIIIa,并且阻碍凝血因子Xa与血小板结合,还能够促进纤维蛋白的溶解,这三条通路都会最终抑制凝血反应。这为解释日本七鳃鳗的吸血生活习性提供了一定的理论依据,同时,提示rLj-TCTP将在临床抗凝治疗方面具有潜在的应用价值。   采用人脐静脉内皮细胞系HUVEC,人宫颈癌细胞系Hela来评价rLj-TCTP蛋白对这两种细胞增殖及其凋亡的影响。本实验运用了CCK-8法,DNA ladder法,流式细胞仪分析,荧光显微镜分析。表明rLj-TCTP蛋白可以促进Hela细胞凋亡,而对HUVEC影响不大。
其他文献
钢管-钢筋混凝土复合桩是一种能够适应深水施工条件的桩基形式,它主要由外部嵌入岩层较浅的钢管和内部嵌入持力层较深的钢筋混凝土组成。钢管—钢筋混凝土复合桩在施工时,先在
  本文以UGIS三维地理信息平台为基础,设计了一种ADS-B飞行监视数据三维可视化显示系统。首先在三维GIS环境下调用数据库数据信息;然后实时绘制高分辨率地理环境下三维飞行航
会议
  车标信息在智能交通领域有着广泛的应用价值。单一的车标识别方法存在识别率低和漏检率高的问题。针对这种情况,本文实现了一种基于SVM多分类器和ASIFT匹配相结合的车标识
胶东地区引黄调水工程是南水北调东线工程胶东输水干线的东段,是山东“T”字形调水大动脉的重要组成部分,是实现全省水资源优化配置、缓解胶东地区水资源供需矛盾、改善当地
随着水利建设的大投入、大发展,水工机械的发展也迎来机遇与挑战,而作为自动抓梁在水利水电工程中的应用也越来越多。当闸门孔口尺寸较大,闸门整体起吊困难时,可将闸门做成叠
  本文面向杂草种子识别提出PCANet的改进型,通过两层多组正交滤波器针对杂草种子图像提取特征,获得特征后利用LMC分类器对其进行分类.通过实验,我们发现这种变体方法取得了很
文章主要从人文角度研究网络时代教育主体在教学过程中所发生的心理变化,探求如何主动利用网络手段,将校内与校外、线下与线上交流融为一体,建立一种无障碍沟通的立体教学模
  针对在车道线检测过程中,运用传统方法不能有效地去除与车道线斜率或者灰度相似的一些直线,提出一种基于Susan算子的车道线检测算法。对经过Canny边缘检测后的图像中所有边
会议
  超声波CT是一种新的检测空气温度分布的技术,本文在研究超声波CT成像原理的基础上,引入最大似然期望最大化(Maximum-Likelihood Expectation-Maximization,ML-EM)迭代算
  传统的mean-shift跟踪算法由于其核函数带宽固定,因而对尺度变化的目标很难进行有效的跟踪。针对这一不足,提出一种基于SIFT特征的带宽自适应mean-shift跟踪算法。在每一帧
会议