水稻白条叶纹突变体st12的精细定位

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水稻是世界上最重要的粮食作物之一,而粮食产量主要取决于植株光和作用的能力,为进一步提高水稻产量,与光合作用相关的重要农艺性状一直是研究的热点,并且已获得了许多重大的成果。叶绿体是叶片中进行光合作用的主要细胞器,深入研究叶绿体发育和叶绿素代谢途径等相关的调控机制,对于理想株型育种和高光效育种都有十分重要的现实意义。  我们在水稻EMS(Ethylmethane sulphonate)诱变突变体库中,发现了以粳稻品种武育粳7号为背景的叶色突变体st12。该突变体在2-3叶期出现纵向的白条纹性状,至分蘖旺盛期性状最为明显,部分叶片可能呈现完全的白色,抽穗期后叶片颜色逐渐变为正常,只在叶脉处有细长的白色条纹。本研究通过对st12突变体进行遗传分析,明确了该突变性状的遗传特性,并利用图位克隆方法对st12基因进行了精细定位,并在此基础上进行了基因预测及初步功能分析。论文主要获得如下几项结果:  (1)突变体st12受单隐性核基因控制。叶色突变体st12单株种植的后代全部表现出突变性状,表明此突变性状能稳定遗传。通过将所选突变体为母本与籼稻品种TN1进行杂交,在F2分离群体中,野生型与突变体比例符合3∶1的分离比,遗传分析表明其受单隐性核基因控制。  (2)透射电镜观察结果显示,突变体中叶绿体内囊体的基粒片层较野生型少,且排列紊乱,嗜锇颗粒数目较多。  (3)利用F2群体中突变体单株进行图位克隆,通过对突变基因st12进行初定位,将其定位于水稻第12染色体长臂的SSR标记RM1246和STS标记YH-1之间,两标记之间相距10.5cM。又发展了6对多态性STS标记进行了基因的精细定位,最终定位在STS标记YH5和YH6之间物理距离为33kb的区间。通过基因预测,此区域中有4个基因,其中有1个是与光敏色素的响应相关的基因,NDPK2。对该基因测序后发现基因发生了单碱基缺失,造成蛋白质翻译提前终止。  (4)此外还进行了相关的生理实验来验证测序的结果。温度梯度实验显示突变体的表型与温度有关,在34℃恒温条件下培养,突变体的表型更加明显,表明突变表型受高温诱导;干旱胁迫和盐胁迫实验均证明突变体的抗逆能力没有野生型强,可能是由于蛋白翻译提前终止,功能丧失造成的,这也验证了我们测序的结果。
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