【摘 要】
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实验目的:以基因表达系列性分析(serial analysis of gene expression,SAGE)构建单纯性肥胖患者腹部脂肪组织基因表达谱,描述新陈代谢相关基因的表达分布。实验对象及方法:临
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实验目的:以基因表达系列性分析(serial analysis of gene expression,SAGE)构建单纯性肥胖患者腹部脂肪组织基因表达谱,描述新陈代谢相关基因的表达分布。实验对象及方法:临床筛查成年单纯性肥胖男性患者,并取其腹部皮下脂肪组织。从脂肪组织中提取mRNA,用SAGE方法分析表达的基因种类,并确定其表达丰度。基因表达系列性分析(SAGE)技术把来自转录物内特定位置的一个短的寡核苷酸序列(含有足够的鉴定一个转录物特异性的信息)作为区别转录物的标签(tag),这个标签相对应只有一个转录产物;再把这些标签串联在一起,形成大量多联体,对每个克隆到载体的多联体进行测序并应用SAGE软件进行分析,最终确定表达的基因种类,并根据标签出现的频率确定基因的表达丰度。实验结果:实验最后总共分离出的标签数有67562个。与新陈代谢相关的标签数有1893个,代表了140个基因,38个基因为功能已确定的代谢相关基因。其中能量代谢相关基因有2个,占代谢基因总数的5.26%,脂代谢相关基因有6个,占代谢基因总数的15.8%,糖代谢相关基因有1个,占代谢基因总数的2.63%,氨基酸代谢相关基因有13个,占代谢基因总数的34.2%,核苷酸代谢相关基因有16个,占代谢基因总数的42.1%。38个基因中,表达丰度最高的是氨基酸代谢相关基因SCAP2,标签数为327,占总标签数的0.48%。此外,还发现了11个新的转录产物,但其相关功能不明。结论:本研究发现单纯性肥胖患者皮下脂肪组织中功能已确定的新陈代谢相关基因有38个,其中表达丰度最高的是氨基酸代谢相关基因SCAP2,占标签总数的0.48%;还发现了11个新的转录产物。
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