论文部分内容阅读
猪肉品质作为猪育种工作中的重要经济性状之一,已经成为育种工作者关注的重点。众所周知,脂肪性状是影响猪肉品质的重要因素,对其进行深入研究将有助于我们找到改善猪肉品质的方法。为此,本试验对影响脂肪性状的两个基因的转录调控机制进行了初步研究,以揭开其转录调控原理的面纱,为下一步的研究奠定基础。本试验主要从以下几个方面对DECR1基因和GPR81基因的转录调控机制进行了研究:(1)通过QT-PCR技术对GPR81基因在大白猪的各个组织表达情况进行定量研究,得出GPR81基因在脂肪、肝脏以及肾脏组织中高表达,其中脂肪组织中表达量最高,其他组织中微量表达或不表达。(2)通过NCBI和EBI数据库查询得到DECR1、GPR81基因5’端上游大约2000bp的调控序列,并对其进行PCR克隆,分别获得2099bp、1798bp的序列。利用生物信息学技术分别对这两个基因的5’端上游转录调控区域进行了预测分析,发现DECR1基因5’端上游转录调控区域内存在AP1、SP1、MZF1等多种常见的转录因子结合位点。对CpG岛分布情况分析,发现没有CpG岛存在;在GPR81基因5’端上游转录调控区域发现有GATA-1、GATA-2、GATA-X、SRY、AML-1α等高分值转录因子结合位点。同样,在GPR81基因5’端上游转录调控区域也没有发现CpG岛存在。(3)对DECR1、GPR81基因5’端上游序列设计一系列缺失片段,构建各个缺失片段的双荧光素酶报告基因载体,并分别在C2C12、3T3-L1、PK15细胞中进行双荧光素酶活性检测。分别对DECR1基因的DP7缺失片段和GPR81基因的GP7缺失片段进一步构建缺失载体,继续进行双荧光活性检测。(4)对双荧光活性测定结果进行分析,并对双荧光素酶活性差异显著的缺失片段间的序列进行生物信息学预测,找出对启动子转录活性起重要调控作用的转录调控因子。通过TFSearch软件对这两个基因进行预测,发现SP1、MZF1转录调控因子和GATA1、GATA2、GATAx转录调控因子可能分别对DECR1基因和GPR81基因启动子具有显著地调控作用。(5)为了进一步鉴定DECR1和GPR81基因5’端上游转录调控区域内的转录因子结合位点和相应的转录因子,我们对这两个基因各个转录因子结合位点进行定点突变,并对DECR1基因的转录因子SP1和GPR81基因的转录因子GATA1进行超表达实验进行验证,此外对SP1转录因子进行siRNA干扰试验验证。结果显示突变后DECR1和GPR81基因5’端上游转录调控区域转录活性显著降低;分别对DECR1基因和GPR81基因超表达SP1和GATA1转录因子,显著地增强了这两个基因5’端上游转录调控区域转录活性;siRNA干扰片段显著地降低了DECR1基因5’端上游转录调控区域转录活性。