凉山半细毛羊微卫星多态性与体重性状的相关分析

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为研究凉山半细毛羊微卫星基因多态性分布及其与体重性状的相关性,选择1,2,3,9号染色体的22个微卫星标记,采用FAM、TET和HEX3种不同颜色的荧光染料标记微卫星引物,对凉山半细毛羊187个个体的基因组DNA进行多重PCR扩增,扩增产物在ABI310测序仪上经变性聚丙烯酰胺凝胶毛细管电泳,检测结果通过GeneScan3.0、Genotyper2.5、Cervus2.0、SAS6.12等软件进行数据分析。表型性状包括羔羊初生重(Birth weight),断奶重(Weaning weight,4月龄),断奶日增重(Weaning daily gain),18月龄体重(18-month weight)。 所选微卫星标记在凉山半细毛羊群体中平均检测到9个(3~17个)等位基因,平均多态信息含量为0.697(0.455~0.861),群体杂合度平均值为0.733(0.51~0.876)。22个标记均呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了可靠的依据。 对试验群体187个后代的体重性状表型资料进行了统计分析。相关分析的结果表明:断奶重与初生重、18月龄体重间存在极显著的正相关,断奶重与断奶日增重只存在显著正相关;初生重与18月龄体重间存在显著正相关。通过标记与性状的关联分析表明:6个微卫星标记分别与不同的体重性状相关,其中微卫星BMS1126和BMS835与初生重相关,BMC1009、ILSTS0049和OarCP0079与断奶重相关,BMS1126、BMS1248和OarCP0079与断奶日增重相关。同时对性状相关显著的标记进行不同基因型间的多重比较,结果发现:标记BMS835中AD、DD、DI基因型,标记BMS1126中BI基因型对初生重影响显著;标记BMC1009中DE、AD基因型,标记ILSTS0049中BD、DD、AC基因型,标记OarCP0079中EF、CF基因型,标记BMS1126中DG基因型对断奶重影响显著;标记BMS1248中EE、DF基因型,标记OarCP0079中CC基因型,标记BMS1126中DG基因型,标记ILSTS0049中AC基因型对断奶日增重影响显著;标记BM1577各基因型对18月龄体重影响显著。 目前我国对绵羊的基因组研究和数量性状的定位还处于起步阶段,本实验不仅为我国在此领域的研究进行了有益的探索,而且为进一步的QTL定位和标记辅助选择提供可靠的依据。
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