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嗜酸氧化亚铁硫杆菌（A cidithiobacillus ferrooxidans; At. ferrooxidans）是生物冶金工业中十分重要的一种细菌。它是一种嗜酸的,需氧的,化能自养的,γ型蛋白质细菌,它的能量来源是通过氧化亚铁或氧化还原性无机硫,最适pH为1.8—2.2。NRAMP （natural resistance-associated macrophage protein）家族的功能是转运金属离子,从细菌到人都发现NRAMP的存在。在At. ferrooxidans中,有两个NRAMP成员,它们是AFE2126和AFE2920。本文首先通过测序At. ferrooxidans DC和At. ferrooxidans DY15两株菌的AFE2126和AFE2920基因,通过序列比对发现At. ferrooxidans DC的AFE2126基因与标准菌At. ferrooxidans ATCC23270的AFE2126基因序列完全相同,而At. ferrooxidans DY15菌的AFE2126基因序列与标准菌At. ferrooxidans ATCC23270菌的AFE2126基因序列相比,有7处碱基位点发生了突变,但由于氨基酸的简并性,只有一个氨基酸位点发生了突变（T48）,由苏氨酸（T48,At. ferrooxidans DC）突变成蛋氨酸（M48, At. ferrooxidans DY15）; At. ferrooxidans DC的AFE2920基因与标准菌At. ferrooxidans ATCC23270的AFE2920基因序列完全相同,At. ferrooxidans DY15的AFE2920基因序列与标准菌At. ferrooxidans ATCC23270的AFE2920基因序列相比有12处发生了突变,但由于氨基酸的简并性,只有一个氨基酸位点发生了突变（A343）,丙氨酸（A343, At. ferrooxidans DC）突变成缬氨酸（V 343, At. ferrooxidans DY15）。通过蛋白质亚细胞定位（PSORTb v2.0 server）,得知At. ferrooxidans DC和At. ferrooxidans DY15的AFE2126和AFE2920蛋白质均位于细胞质膜上；通过跨膜分析（TMHMM v2.0 server）,得知AFE2126和AFE2920蛋白质均跨膜11次。通过转运基序分析（Motif Scan server）得知At. ferrooxidans DC和At. ferrooxidans DY15的AFE2126和AFE2920的NRAMP保守转运基序分别为5’-QVIASIFMPAAMLFLLMLLNDREIMGSYVNRR-3’和5’-IITAAQSGAQWGFKLLLLQFVLMPILYIVQELTVRLGIFTGK-3’。通过PCR和测序得到At. ferrooxidans DC的7个候选内参基因的序列和大小为AFE2121（map,810 bp）, AFE2475（gmk,639 bp）, AFE2714 （rplL,387 bp）, AFE2150（gyrA,2538 bp）,AFE2114（recA,1038 bp）, AFE1680（era,915 bp）, AFE2711（rpoC,4155 bp）。通过序列比对发现,这7条序列与标准菌At.ferrooxidans ATCC23270的AFE2121（map）, AFE2475（gmk）, AFE2714（rplL）, AFE2150 （gyrA）, AFE2114（recA）, AFE1680（era）, AFE2711(rpoC的序列完全相同。用RT-qPCR （the Reverse Transcription fluorescence-based quantitative real-time PCR）分析了At. ferrooxidans DC菌在6个不同培养条件下的7个候选内参基因的转录水平,用geNorm评估了7个候选内参基因mRNA的转录稳定性,转录稳定的顺序由大到小是era, gmk, rpoC, gyrA,recA, map, rplL。选择mRNA转录最稳定的3个基因（era,gmk, rpoC）作为目标基因的内参基因,研究了At. ferrooxidans DC目标基因AFE2126和AFE2920基因的mRNA在不同亚铁离子的浓度下的转录水平,表明随着亚铁离子浓度的增加,基因AFE2126的转录水平降低,但是AFE2920基因转录水平没有明显变化趋势。