太赫兹（THz）通信有着大带宽，定向性好，散射小等优点。无线通信的频谱资源非常有限，而人们对于通信带宽的需求日益增长，THz通信将有助于解决现在通信频谱资源紧缺的问题。THz滤波器是THz通信中重要器件之一，把光子晶体技术应用到太赫兹通信器件的研究中已经形成一个热点，随着波分复用技术在THz通信中的应用，THz多波长滤波器的研究具有重要意义。本文设计了一种基于组合谐振腔THz双波长滤波器，首先对光子晶体滤波器的理论和研究方法进行了分析，利用在完整光子晶体上引入三个点缺陷构成的组合型谐振腔、线缺陷，设计了具有双波长选频滤波功能的新型THz滤波器。然后采用FDTD方法对该新型滤波器中组合谐振腔处的两个缺陷模影响因素、滤波器主波导和滤波波导的透射谱进行仿真分析，根据仿真结果对新型滤波器的结构参数进行了优化，最后分析了结构参数对新型滤波器的各项性能指标的影响，分别给出了对应两个波长的时域稳态响应图。结果表明，本文设计的新型滤波器可以在3.413THz（87.9μm）和3.225THz（93.02μm）进行选频滤波，滤波器中两个缺陷模的耦合滤波效率都达到了95%以上，主波导中的光能量基本被耦合到滤波波导中，可以实现高效率耦合滤波。新型滤波器对87.9μm波长的响应时间约为0.6ns，而对于93.02μm波长的响应时间达到了0.2ns，滤波器能很快地进入稳定状态。仿真结果表明，本文设计的THz滤波器的谐振腔品质因子Q值达到了1000以上，可以实现超窄带滤波，并且滤波器的插入损耗小、信道隔离度大、滤波效率高、响应时间快并且抗干扰能力强，在太赫兹波高速通信系统中具有重要的应用前景。