心肌缺血-再灌注损伤不同时序转录组分析及功能探究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kftgb1221
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
急性心肌梗死患者血运重建治疗的广泛开展,极大地减少了心肌梗死面积,改善了患者预后。但随着心肌组织血流灌注的恢复,心肌发生缺血-再灌注损伤(Myocardial Ischemia Reperfusion injury,MIRI),使心肌损伤加重,引发心肌细胞凋亡、心肌顿抑等不良事件,导致院内心梗患者血运重建后仍有心力衰竭发生、心脏骤停的风险。以往对MIRI的机制和评价得到广泛的重视和研究,但都局限在组织病理学、心肌损伤标志物和氧化应激等方面,而非编码RNAs作为疾病病理生理过程的分子标记、治疗靶点具有巨大的潜力。为此,我们从非编码RNAs的角度探究心肌缺血再灌注损伤的转录后调控机制,以期更早地预警缺血再灌注损伤,并成为治疗靶点,减轻缺血再灌注损伤,改善心肌梗死后血运重建患者的临床结局。本研究在动物水平构建心肌缺血-再灌注损伤模型,通过对心肌缺血再灌注损伤不同时间的组织进行测序及分析,得出随再灌注损伤过程时间变化的非编码RNAs调控分子。之后,利用实时荧光定量PCR(Quantitative Real Time PCR,q PCR)及蛋白印记检测(Western blot,WB)检测的方法,在MIRI心肌组织及缺氧/复氧(Hypoxia/Reoxygenation,H/R)诱导的细胞凋亡模型上,对测序结果中最显著变化的11个分子进行验证实验。验证后,利用基因干涉技术,对随时间变化显著的分子LncRNA MAPKAPK5-AS1、mi R-124-3p的功能进行探索。第一部分 缺血后不同再灌注时序大鼠心肌组织转录组学测序研究目的:在动物水平构建MIRI模型,通过对MIRI不同时间的组织进行测序及分析,明确随再灌注时间变化的非编码RNAs调控分子。方法:应用结扎大鼠冠状动脉前降支方法构建大鼠的MIRI模型,结扎时间为30分钟,随后解开结扎线使心肌重新获得血流,进行再灌注损伤模型构建,分别在再灌注30分钟、60分钟、120分钟时处死大鼠,腹主动脉采血,开胸取心肌组织,提取心肌组织RNA及蛋白质,应用苏木精-伊红(Hematoxylin-Eosin Stain,HE)染色、免疫组化染色观察组织学形态,应用酶联免疫检测法(Elisa)对血清心肌损伤标志物进行模型的评价。提取的RNA经过质控后,各组选取3个心肌,使用高通量测序技术对心肌组织进行测序,分析各时间节点差异表达的m RNA、LncRNA、mi RNA情况,利用GO及KEGG通路富集分析,预测各种非编码RNA及m RNA之间的靶标关系,并根据时序趋势找寻随着MIRI程度变化显著的分子,利用生物信息学预测MIRI随时间变化的转录后调控机制。结果:1、在MIRI早期(再灌注30分钟),差异表达的m RNA有177个、LncRNA11个、mi RNA 2个,这些RNAs的差异表达主要集中在炎症、氧化应激等病理生理过程。2、在MIRI晚期(再灌注120分钟),差异表达m RNA 143个、LncRNA 330个、mi RNA 115个,这些RNAs的差异表达集中在细胞凋亡、细胞周期调控等病理生理过程。3、在MIRI全程,有11个调控分子随再灌注时间变化差异显著,分别是LOC10369223、Lnc MAPKAPK5-AS1、LOC102553854、LOC103690547、mi R-124-3p、mi R-21、mi R-615、mi R-125-5p、E2F3、PTEN、PI3K。第二部分 qPCR及WB鉴定心肌缺血后随再灌注时间变化的分子表达水平目的:由于测序结果是基于各组的3个大鼠心肌所得,为了验证测序结果及避免系统误差,我们利用q PCR及WB检测的方法,在动物及细胞模型上对第一部分实验中测序所得的11个调控分子进行验证。方法:动物水平验证使用的是第一部分非测序的大鼠心肌组织。细胞水平验证使用H/R法构建的H9C2心肌细胞凋亡模型。提取组织及细胞内的RNA及蛋白质,利用PCR及WB检测在动物水平及细胞水平对测序结果中最显著变化的11个分子进行验证实验。结果:1、细胞H/R模型及MIRI心肌组织的q PCR及WB结果显示,随时间变化最显著的11个调控分子的定量分析与高通量测序结果一致;2、在MIRI过程中,mi R-124-3p和LOC103690547随再灌注时间进展表达水平逐渐下降,mi R-615、LncRNA MAPKAPK5-AS1随再灌注时间进展表达水平逐渐升高,提示其可能参与MIRI发生发展的全过程。第三部 下调LncRNA MAPKAPK5-AS1通过作用于mi R-124-3p及E2F3从而改善H/R诱导的心肌细胞凋亡的机制探索目的:验证测序结果后,通过生物信息学分析和机制推测LncRNA MAPKAPK5、mi R-124-3p及E2F3可能存在调控关系。通过改变H9C2心肌细胞内LncRNA MAPKAPK5-AS1的水平,检测心肌细胞凋亡情况,明确下游分子mi R-124-3p及E2F3变化情况,验证是否能通过下调LncRNA MAPKAPK5-AS1从而改善H/R诱导的心肌细胞凋亡的机制探索。方法:使用质粒载体及干扰RNA改变和H9C2心肌细胞LncRNA MAPKAPK5-AS1表达量后,再构建H/R模型,利用q PCR及WB检测细胞凋亡标志物化及mi R-124-3p及E2F3的表达变化。使用双荧光色素酶报告系统明确LncRNA MAPKAPK5-AS1、mi R-124-3p及E2F3的靶标关系,从而推测出下调LncRNA MAPKAPK5-AS1在改善H/R诱导的心肌细胞凋亡作用的机制。结果:1.在细胞过表达LncRNA MAPKAPK5后,抗凋亡蛋白表达下降、促凋亡蛋白表达增加,说明LncRNA MAPKAPK5的过表达会加重缺氧/复氧诱导的心肌细胞凋亡;2.在细胞过表达LncRNA MAPKAPK5后,mi R-124-3p表达下降,E2F3表达增加,在细胞沉默LncRNA MAPKAPK5后,mi R-124-3p表达上升,E2F3表达减少。同时沉默LncRNA MAPKAPK5及mi R-124-3p后E2F3表达恢复至正常水平,说明三者存在一定的调控关系;3.双荧光色素酶报告系统证实LncRNA MAPKAPK5/mi R-124-3p/E2F3的靶标关系。结论:1.不同基因在缺血再灌注损伤过程中表达发挥的时序不同,mi R-124-3p、LOC103690547在MIRI全程持续低表达、mi R-615、LncRNA MAPKAPK5在MIRI全程持续高表达,有望成为心肌缺血再灌注损伤时序敏感的分子标记物;2、通过下调LncRNA MAPKAPK5的表达能改善心肌缺氧/复氧后的心肌凋亡,可能成为改善MIRI的治疗靶点;3、下调LncRNA MAPKAPK5的表达后,能上调mi R-124-3p,下调E2F3的表达,从而减轻H/R诱导的心肌凋亡。
其他文献
在英语阅读教学中落实英语学习活动观,教师首先需要创设语境,基于学生已知,引入主题意义;之后引导学生紧紧围绕主题意义,获取、梳理、整合语言知识;进而围绕主题意义,巩固语言知识,深化语言理解;最终通过迁移情境,帮助学生内化所学,从而围绕主题意义开展探究活动,实现发展语言能力、增强文化意识、提升思维品质和提高学习能力的培养目标。
学位
信息时代,我国经济市场发展速度较快,人民生活质量提高,精神需求越来越多。面对消费者的需求,经济市场出现越来越多的新型产品,对推动社会发展有重要存在意义,对提高消费者生活质量有重要推动作用。企业向消费者有效介绍产品的方式是市场营销,为推动市场营销发展,国家教育部将市场营销作为重要专业进行研究发展。在市场营销学中,广告有十分重要的作用,本文主要讲述广告宣传策略在市场营销中的重要作用,在市场营销中广告宣
学位
学位
随着国防、航空航天、信息与通信技术、汽车和消费电子等众多行业需求的不断增长,宽禁带半导体市场展现出较好的发展前景,科研人员对宽禁带半导体材料的研究兴趣愈发浓厚。作为在紫外及深紫外光电器件领域具有良好应用前景的宽禁带半导体材料,六方氮化硼(hBN)由于其独特的晶体结构、物理和化学性质,引起了人们的广泛关注。起初,由于优异的热导率、化学稳定性、耐火特性、绝缘特性和润滑特性,hBN粉末和陶瓷材料得到广泛
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)是由于大脑血管堵塞使血流量减少或中断引起大脑缺血缺氧,继而导致脑组织损伤的一种临床常见疾病。缺血性脑卒中发生后往往都伴随血管再通,血流再灌注,从而进一步加重细胞代谢障碍及结构破坏,导致神经功能严重缺损,即脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia reperfusion injury,CIRI)。氧化应激反应在脑缺血再灌注损伤中起着关键
改革开放以来,中国经济发展取得了举世瞩目的成就。但与经济增速形成鲜明对比的是,中国的环保问题越来越突出,尤其是酸雨问题严重,制约着中国经济的持续健康发展。2019年在中国469个监测降水的城市(区、县)中,酸雨频率平均为10.2%,酸雨城市比例为16.8%,酸雨区面积约为47.4万平方千米,占国土面积的5.0%。中国的酸雨类型多为硫酸型酸雨,主要是由于二氧化硫过度排放导致的。由此可见,解决酸雨问题
胃癌是死亡率极高的恶性肿瘤之一,位列全球肿瘤死亡率第三,早诊早治可有效降低其死亡率,早筛标志物的发现及应用对改善胃癌预后至关重要。鱼精蛋白1(PRM1)是一种新型的癌症睾丸抗原,生理状态下仅在睾丸组织中表达。本课题组通过前期实验表明PRM1在胃腺癌组织中高表达,但在胃腺癌中的诊断价值及生物学作用并不清楚。本研究通过双中心、大样本回顾性分析PRM1作为新型肿瘤标志物在胃腺癌早期诊断、预后判断中的作用
作为"我和我的"国庆献礼系列电影的第三部,电影《我和我的父辈》延续了"拼盘式"短片组合的结构方式。该片在"精神传承"这一宏大主题的框架下,采用儿童视角的叙事策略,以小见大地诠释家国情怀;通过多样类型叙事方式,拓展优化电影表现空间;借助穿越时空的线性叙事,生动展现生生不息的民族精神。影片勾勒出中国共产党领导中华儿女百年来英勇奋斗、薪火相传的伟大征程,在红色光影艺术中展现中国共产党人伟大的精神谱系,串