小麦及其供体种抗病序列分离与标记开发

来源 :山西大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:VBlover
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了抵御病原菌的侵染,植物在长时间的进化过程中产生了多种抗病保守结构,其中PK和NBS分布最为广泛。2013年粗山羊草和乌拉尔图小麦以及2014年普通小麦全基因组测序的完成,使得快速分离和分析基因家族成为可能。本研究主要对粗山羊草全基因组和抗病基因Pm43所在普通小麦基因组区段内的NBS、PK类抗病基因家族进行分离分析,同时又进行了乌拉尔图小麦NBS家族全基因组分离,染色体定位,进化及抗性表达分析,主要结果如下:  (1)在粗山羊草全基因组中获得的NBS、PK完整蛋白序列分别为701、1499条,其中,AetNBS序列均具有定位信息,7D染色体上分布最多为165条,4D染色体上分布最少,仅有29条;而1499条AetPK中,共有1186条序列具有定位信息,5D染色体上序列最多为217条,4D染色体最少只95条。通过将定位于5DL染色体上的NBS和PK序列对应的Scaffolds进行SSR检索并设计引物,然后将所设计的264对引物在粗山羊草Y201(携带PmY201)/Y2272F2群体亲本和抗感池进行多态性筛选,共有2个NBS和7个PK标记在抗感亲本和抗感池间均具有多态性,最后利用作图群体进行连锁性验证,其中7对PK-SSR标记可以定位到作图群体的连锁图上。  (2)从乌拉尔图小麦中共筛选出463条含有NBS结构的完整蛋白序列,其中461条序列具有定位信息,在7条染色体中7A上分布最多,有96条;6A染色体上分布最少,有39条。利用NBS蛋白构建系统进化发育树,共得到118对同源基因。据染色体位置推断,乌拉尔图小麦NBS家族中可能发生过63次串联复制和55次片段复制,复制事件发生于4380.84~3.46Mya(million years ago),且所有乌拉尔图小麦NBS同源基因对的Ka/Ks均小于1,说明乌拉尔图小麦NBS家族在复制后被进行纯化选择。然后对经Blumeria graminis f.sp.tritici(Bgt)感染的乌拉尔图小麦RNA-seq数据进行分析,在三个品种Tu38,Tu138和Tu158中筛选出6个共有的表达差异基因。  (3)Pm43是本课题组定位在2DL染色体上的抗白粉病基因。本研究通过相互比对确定了Pm43对应于2D染色体物理图谱、遗传图谱和基因组图谱上的位置区段,并从区段内检索出89条RGA-scaffold,通过对含有SSR位点的RGA-scaffold开发标记及连锁性测验,将目的区间再次缩小在PK_9908430和NBS_9908778两个标记间。之后利用聚类分析,筛选出两个(NBK和PK序列各一个)与已克隆Pm基因间同源性较高的序列,与这两序列有同源性且进行表达的RGA序列在粗山羊草和水稻中也有。
其他文献
辛桂梓在全省组织系统深入推进“讲党性、重品行、作表率”活动视频会议上强调3月1日,中央组织部召开全国组织系统深入推进“讲党性、重品行、作表率”活动视频会议。省委常
山坡绿是以舒城群体种中叶型为原始材料,经系统选种,无性繁殖选育而成的。品种比较试验表明:该品种优质、高产、抗寒抗旱、早生,适制名优绿茶,成年茶园适于机械化操作。 Hil
干旱胁迫是全球限制作物生产的主要气象灾害。中国是受干旱严重影响的农业大国,干旱胁迫正严重制约着农作物产量潜力的发挥。因此,选育耐早作物品种、提高作物的耐/抗旱能力是作物生产急需解决的关键问题之一,而挖掘耐早种质、明确作物耐旱机理是培育耐旱新品种和制订抗旱栽培措施的基础。大麦(Hordeum vulgare)适应性强用途广,是全球各地普遍栽培的第四大谷类作物。然而,现代育种方法使得栽培大麦的多样性和
本刊讯(记者陈文静)去年,针对群众反映比较强烈的教辅资料征订、补课收费、择校收费等问题,全省累计检查高校和中小学校11050所,清退违规收费1262.89万元,并查处各类案件(含
百萨偃麦草(Thinopyrum bessarabicum Love,2n=2x=14, JJ or EbEb)携有多种抗病和抗逆基因,是小麦改良的重要基因资源。为转移、定位和利用这些基因,南京农业大学已经选育了多个二体附加(代换)系,但尚未选育出涉及完整1J染色体的二体附加或代换系。本研究在前人工作的基础上,对涉及1J和6J染色体多重添加系的自交后代进行分子标记、贮藏蛋白分析和细胞学鉴定,选育出
近年来,农业面源污染日益加剧,所带来的污染易引起人们广泛关注,特别使造成的水体富营养化问题日益严峻。所以,研究农业面源污染控制具有非常重要的现实意义。对于巢湖流域,农业面
摘要目的评估标准摄取值(SUV)和表观扩散系数(ADC)单独及联合应用的独立预后价值,以评估这两个变量联合是否能够为头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)病人提供进一 Abstract Objective
大豆疫霉病是一种土传病害,严重影响大豆的产量,目前对美国、巴西、阿根廷、中国等国的大豆生产都产生了很大影响。大豆疫霉遗传变异丰富,新的生理小种不断涌现,不同地区间具
Most stream data classification algorithms apply the supervised learning strategy which requires massive labeled data.Such approaches are impractical since labe
植物地上部分覆盖着一层蜡质作为表皮的保护层,角质层蜡质决定的功能对于植物十分重要。蜡质具有防止紫外线辐射损伤,减少植物表面水分过度蒸发和抵抗病虫害侵入等功能,在植物对