近年来,基于基因组规模代谢网络模型的代谢优化算法不断涌现,在代谢工程领域内发挥着越来越重要的指导作用,并且取得一定的成效。然而,很多此类算法受制于时间等因素限制而难以识别更加综合的代谢工程策略,尤其是识别敲除靶点的算法最为突出：不仅受敲除个数的限制,而且往往给出的敲除策略难以平衡生产和生长。本文提出了一种新的基于基因组规模代谢网络模型识别敲除策略的方法,并命名为IdealKnock。IdealKnock基于生产型菌株的流量分布指引识别敲除靶点,从野生型出发,逐步累加敲除突变,可以快速寻找到敲除策略。基于大肠杆菌iAF1260模型,本研究将该方法用于识别多种细胞自身代谢物和一种外源代谢物番茄红素的生产敲除策略。计算结果表明IdealKnock通常可以在不受敲除个数限制的条件下快速识别(20分钟以内)出综合性和鲁棒性较强的敲除策略,并且还可以支持寻找能够较好平衡生产与生长的敲除策略。此外,IdealKnock与OptKnock的联用能够非常高效地(通常2分钟以内)简化IdealKnock的敲除策略。最后,通过借助可视化的全局代谢网络来分析模拟结果,我们举例说明了IdealKnock的敲除策略的内在生物学含义,表明其有一定的实际代谢工程指导意义。