在我国全面深化改革的时代背景下,税务工作也面临着转型变革。跨区域税务稽查作为新型的稽查管理体制,随着国地税合并、深化税收征管体制改革下应运而生,打破行政“属地管理”,在撤销县级税务稽查局的基础上,设立省、市级跨区域稽查局,在整合稽查资源、解决多头检查、统一执法标准、重拳打击要案、提升稽查质效等方面体现了显著的优势,对提高税收执法刚性、营造公平有序的环境具有积极影响。与此同时,伴随着税收治理现代化的新形势,原有稽查体制与新型稽查体制的磨合必然产生共性和个性的执法风险,职能定位不清、部门协调不畅牵制了打击虚开骗税力度,增加了纳税遵从风险;依法治税不断推进、纳税人维权意识的提高与法律法规体系的不完善、稽查执法效力依据等级低之间的矛盾,增加了执法法治风险;基于税务机关与纳税人征纳双方的博弈关系,执法不当引发追责的执法程序性风险;因外部环境日趋复杂,跨区域稽查人员长期出差、难以监管,增加了被“围猎”风险以及高素质专业人才与职业发展规划不匹配造成人才流失风险等,新形态、新特征的多重执法风险交织竞合,紧密关联又相互诱发转化,如何防控风险、充分发挥跨区域税务稽查效能已成为新形势下税务部门迫切需要解决的问题。本文运用全面风险管理、协同治理理论,阐述对跨区域税务稽查的现状、风险种类及特点,采取二手资料分析、实证调研、案例研究等研究手段,借鉴国内外先进经验,客观分析跨区域税务稽查工作中存在的执法风险及成因,提出构建风险联防联控机制和常态化协作机制,为跨区域税务稽查发挥独特作用、更好打击税收违法犯罪、促进经济发展、构建良好营商环境提供参考。