代谢对于癌症至关重要。在癌细胞中,许多代谢通路被重调,以适应癌症的特异需求,或促进癌症的发生发展。本研究整合了癌症基因共表达网络和代谢酶网络,以深入探索癌细胞代谢过程。通过癌症基因共表达网络,我们找出了在癌细胞中显著上调或下调的基因共表达模块。模块中有一些酶基因具有比预期更多的基于代谢酶网络的连接数,我们认为,这些酶的表达及活性水平的改变、或针对相应代谢物水平的干预可能对癌细胞代谢过程具有重要影响。因而,这些酶基因及相应代谢物具有成为癌症治疗靶点和药物的潜能。我们将此整合网络的方法称为Met-express,其中Meta指代谢酶网络,而express指基因共表达网络。Met-express被用于肺癌、白血病和乳腺癌中,对每一种癌症都预测了一系列关键酶基因和关键代谢物。依据数据库和文献搜索,我们发现大约20-30%的关键酶基因被用作已知治疗癌症药物的靶点,或有文献认为其具有成为新靶点的可能。另外,有50个代谢物出现在所有三种癌症预测结果中,其中4个是已知的治疗癌症药物,另有较大比例的代谢物被文献认为具有抗癌效果。综上所述,Met-express作为整合网络研究疾病代谢的新方法,不仅能预测具有癌症治疗潜能的关键酶及代谢物,同时为研究多种疾病的代谢过程提供了一个新平台。