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【目的】探讨ID-1与CD44S的mRNA及蛋白在结直肠癌组织中的表达情况，阐述其在结直肠癌中的表达特征及临床意义。【方法】采用实时荧光定量PCR法检测30例结直肠癌病例新鲜组织中癌组织与正常大肠组织中ID-1与CD44S的mRNA表达，采用免疫组织化学染色方法(S-P法)分别检测81例结直肠癌患者癌组织、20个正常大肠组织的中ID-1与CD44S的蛋白质表达，并分析它们与临床病理特征的关系。【结果】1、实时荧光定量PCR实验的结果显示，ID-1mRNA与CD44SmRNA在结直肠癌癌组织中的相对表达量均比正常大肠组织中的相对表达量高，二者比较，其差异有统计学意义（P<0.01）。2、CD44S蛋白在结直肠癌癌组织的阳性率为96.3%（78/81），其表达强度与肿瘤细胞的分化程度呈负相关，在正常大肠上皮中的阳性率为35%（7/20），而且其表达仅见肠隐窝的未分化细胞，而在分化成熟的正常柱状上皮中不表达；CD44S蛋白在结直肠癌癌组织与正常大肠上皮中的阳性表达的显著不同，其差异有统计学意义（P<0.01）。ID-1蛋白在结直肠癌癌组织的阳性表达率为81.48%（66/81)，其表达强度与肿瘤细胞的分化程度呈负相关；在正常大肠上皮中的表达率为0%（0/20)；ID-1蛋白在结直肠癌癌组织与正常大肠上皮中的阳性表达显著不同，其差异有统计学意义（P<0.01）。3、对ID-1与CD44S在结直肠癌癌组织中的mRNA和蛋白表达水平进行Spearman相关统计分析发现：30例结直肠癌新鲜癌组织中ID-1与CD44S的mRNA表达有正相关趋势，且有统计学意义（r=0.471，P<0.01）；81例结直肠癌癌组织的ID-1与CD44S的蛋白表达有正相关趋势，且有统计学意义（r=0.575，P<0.01）。4、连续切片的免疫组化染色结果显示，低分化腺癌的病例中ID1与CD44S蛋白同时出现强表达，中高分化腺癌的病例中则同时出现弱表达。【结论】1、结直肠癌癌组织中ID-1mRNA与CD44SmRNA的相对表达量均高于正常大肠组织；ID-1蛋白与CD44S蛋白在结直肠癌癌组织中高表达，且其表达强度与肿瘤细胞的分化程度呈负相关，在正常大肠上皮中弱表达或不表达；同时CD44S的表达强度与淋巴结转移呈正相关。2、ID-1与CD44S的mRNA与蛋白在结直肠癌癌组织中有协同表达，存在正相关趋势；在低分化腺癌的病例中ID-1与CD44S蛋白同时出现强表达，中高分化腺癌的病例中ID-1与CD44S蛋白则同时出现弱表达。3、CD44S蛋白在正常大肠组织肠隐窝根部的未分化细胞中表达，在分化成熟的柱状上皮中不表达，结合CD44S蛋白在肠癌组织中的表达特征，提示CD44S可以作为结直肠癌的肿瘤干细胞标志。