本文以公司型基金治理和契约型基金治理为主要研究对象，所采用的分析思路是从基金治理理论分析到基金治理具体模式的对比分析，再到国际国内基金治理实践状况的分析研究，通过理论分析、比较分析与实证分析相结合的方法探索我国基金治理的最优途径，即通过发展公司型基金以更好的实现基金持有人利益保护。　　在本文导论部分，介绍了当前基金行业发展的总体趋势，并且指出了当前基金业发展中所存在的问题，在此背景下提出了从基金持有人利益出发研究基金治理结构的理论意义和实践意义。　　随后文章分析了基金治理理论，认为委托代理理论夸大了经理人员的机会主义倾向以及市场效率的作用，从而使经理人员在经营决策时，过度考虑市场效率，以追求自身的短期利益，而不是为公司的长远发展以及整体利益考虑。不完全契约理论下，由于基金契约是不完全的，因此，基金治理的核心就是如何处理基金剩余控制权与剩余索取权的安排，以更有利于保护资金持有人的利益。接着，本文以基金治理理论为基础，对契约型基金与公司型基金进行比较分析，并得出结论:第一，在投资人和基金管理人之间的委托代理问题或道德风险问题方面，公司型基金治理的治理风险小于契约型基金治理，从这个意义上说公司型基金治理更具有优越性;第二，在不完全契约的视角下，基金选择公司型治理更能保护基金持有人利益，并且更有利于基金行业的发展，因此公司型基金治理更具有优势。此后本文通过对英、日、美三国的基金治理模式的比较研究，指出公司型基金是当前国际基金行业发展的主流选择和主要趋势，并提出我国从基金持有人利益保护出发，应尽早发展以独立董事制度为特征的公司型基金。　　然后，本文从四个方面进一步论证了我国发展公司型基金的必要性:第一，当前我国契约型基金存在严重的治理问题;第二，公司型基金的治理优势，可以弥补契约型基金治理的缺陷，尽管契约型基金治理结构中设计了一系列的监督管理机制，但是很难对基金管理人形成实时的、有效的监督制约，从而也很难真正的实现基金持有人利益保护，但在公司型基金治理结构下，通过基金独立董事制度很好的解决了这个问题，独立董事能够从基金持有人利益出发，对基金管理公司的决策、行为进行及时的、有效的监督制约，从而公司型基金在基金治理上更具有优势;第三，从市场竞争的角度考虑，推出公司型基金可以丰富投资者的选择，对于契约型基金的发展也有好处，为了在市场竞争中生存，只有不断完善其治理结构，才能适应市场的要求，并且契约型基金与公司型基金在市场中的相互竞争，也能够促使它们更加注重基金持有人的利益保护，这对于投资者来说更有实际意义;第四，公司型基金是当前世界基金业发展的主要趋势。　　此外，本文还从实践运行的角度考察了我国发展公司型基金所面临的障碍:法律上存在的障碍、制度环境上的缺陷，以及制度变迁的“路径依赖”;并提出了相应的对策:构建公司型基金法律体系，完善基金公司独立董事制度及其外部运行环境，以及由国家自上而下推出公司型基金。　　最后，根据文章的论述，进一步明确指出文章的结论，并且提出了文章的不足之处以及将来工作中有待继续深入研究的地方。