本研究对以越光、昌恢121互为背景的两套染色体片段置换系进行了加代纯合,进一步的追踪目标片段,结合分子标记辅助选择技术,使这两套染色体片段置换系更趋于完善。并利用代换作图法,进行了粒型性状QTL定位,主要结果如下:（1）采用均匀分布于12条染色体的180个SSR分子标记,筛选以昌恢121和越光互为遗传背景的BC₃F₅、BC₄F₄和BC₅F₃世代的目标株系,获得以昌恢121为遗传背景的染色体片段置换系目标单株98株,平均每个单株置换的分子标记数占总标记数的比例为4.92%,置换的标记数目为8.85个,其中,纯合供体基因型标记4.21个,杂合基因型标记4.64个。获得以越光为遗传背景的染色体片段置换系目标单株107株,平均每个单株置换的分子标记数占总标记数的比例为5.44%,置换的标记数目为9.79个,其中,纯合供体基因型标记4.70个,杂合基因型标记5.09个。（2）利用代换作图法在以昌恢121为背景的染色体片段置换系中共检测出与粒长相关的染色体片段10个,与粒宽相关的染色体片段9个,与千粒重相关的染色体片段10个。其中有6处QTL簇集区段:1号染色体RM6387-RM5362区段可能集中了控制粒长与粒宽的QTL;2号染色体上RM8252-RM1092区域,可能存在控制粒型和千粒重的QTL;5号染色体上RM7444-RM2998区域,可能存在控制粒型和千粒重的QTL;7号染色体上RM5752-RM7110控制粒长和千粒重;8号染色体上RM4085-RM6990区段控制粒型和千粒重以及10号染色体上的RM2125-RM5708区段控制粒型和千粒重。（3）与前人研究对比,1号染色体上的区域被多次在不同群体中重复检测,其间很可能带有控制粒长增加的片段,推测应存在一个控制粒型与粒重的QTL的染色体片段,但尚未被克隆出QTL。3号染色体上的RM3646处的置换片段,与GS3位置接近,且对粒长呈现负效应,很可能是同一基因。5号染色体上区段同样被多次在不同群体中检测出,具有进一步研究的价值。10号染色体上前人研究较少,所定位关于粒重与粒型的QTL多在长臂末端,本研究发现区域位于短臂近着丝粒处,尚无相关报道。