自2005年前国民党主席连战访问大陆以来，国共两党之间的交流与合作日趋深入。双方为增进两岸和平，谋求两岸人民福祉方面达成了许多共识。2005年下半年国民党实现世代交替，马英九成为新一代的领导核心，尽管2007年初他因特别费案辞去党主席职务，但仍保持实质的影响力，仍是国民党重夺执政权的最大希望之所在。因此，研究马英九的政治主张，并探讨其对两岸关系的影响无疑是有一定的现实意义的。 影响马英九政治主张的诸因素中，有内外因两大方面，外因中美国因素、大陆因素以及岛内政治生态至为关键。美国认为马英九是积极的“利益相关者”而不是“麻烦制造者”，对其维持两岸关系现状的主张比较放心，但也担心他会与大陆走得过近。马英九对美国的这一心态是充分了解的，所以他在言行中刻意与大陆保持距离。大陆因素是影响马英九政治主张的最重要的因素之一，两岸关系是他选战中的关键牌，他必须努力把握好平衡，既要在和平、经贸等议题上为自己加分，又要防止对手“抹红”及美国不安。而~大陆对他既有期待，也对他的有关言论持保留态度。岛内因素直接影响着马英九的政治主张，他既要整合泛蓝，稳定铁票，又要争取中间选民，同时针对对手的软肋，提出吸引选民的主张。 而内因主要有中华情结、学术背景、人格操守、民主理念、新台湾人身份及政治投机性等。本文认为马英九对一个中国的认同是可以确信的。他的学术背景及尊重法律的操守为他的所作所为打下了浓厚个性特色的印记。而外省人的身份使得他处于较尴尬的位置，他不得不为其政治主张寻求“本土”认同。为了选战，他只得走中间路线，有时左右摇摆，因而也给人以投机的印象。 马英九政治主张很多，对两岸关系及岛内重要政治事务的基本主张是研究的重点。马英九对两岸关系的基本主张有维持现状、坚守“五不”，回归“九二共识”，“五要”与“双P”，终极统一论等。核心是不谈统独，维持现状，促进两岸的交流与合作。对岛内重要事务的基本主张则为正视台湾的历史与法律地位、批驳台湾地位未定论和反对台独，主张维护族群团结、增进社会和谐与进步等。另外本文也简要介绍了他的党外对手谢长廷的相关主张。 马英九的政治主张既关系到他2008年选战的成败，也需籍由夺得执政权予以实现。故本文也分析了他问鼎之路上的主要障碍。探讨了国民党在重夺执政权及继续失利两种情况下对两岸关系将带来的可能影响。如能赢得执政权，将有利于两岸的和平与稳定及两岸人民的交流与合作，但也会给大陆带来一些难题；而如果失利，民进党将进一步独大，国民党有泡沫化的可能，台独意识将有可能成为岛内的主流意识，两岸的统一将更为任重道远。