小麦全蚀病是小麦上的毁灭性病害，近几年该病害在河南省的危害逐年加重，严重影响了河南省小麦的安全生产。为了弄清楚河南省小麦全蚀病病原菌的情况，本试验从河南省郑州、许昌、开封、漯河、商丘、周口和驻马店等7个地区10个县（市）分别采集具有典型症状的小麦全蚀病病株样本，经室内组织分离、纯化，共得到小麦全蚀病菌74株。通过对供试菌株进行形态学，生理生化特性的鉴定，并对其rDNA-ITS区段序列和致病力进行分析和测定，旨在确定河南省小麦全蚀病菌变种类型，以及不同地区，不同菌株之间的致病力差异。形态学鉴定的结果表明：在PDA培养基上，菌落呈圆形，生长初期呈现灰白色，后期颜色加深，变成灰褐色乃至黑色，菌落的边缘向中心反卷。所有供试菌株均有褐色粗壮的匍匐菌丝，并在分枝处形成“∧”的典型特征；均产生瓶梗孢子，新月形或者半月形；只产生卵圆形，长棒形或者近球形的简单附着枝，常簇生，形成微菌核团；采用PD三角瓶法人工诱导子囊壳，供试菌株均可产生子囊壳，埋生或者半埋生，也多见于瓶壁的菌丝间，单生，壳体球形或卵圆形，黑色，外有茸状菌丝；子囊单壁，成熟后棍棒状，上部钝圆，下部稍窄具柄，大小为98.6～127.9μm×9～15μm；子囊孢子线形，稍弯曲，成熟的子囊孢子具有清晰的隔膜，大小为98.6～127.9μm×9～15μm。生理生化特性的研究分析结果显示：大多数供试菌株的最适宜生长温度为25℃，最适宜PH为7.0。2.5％的新鲜燕麦汁PDA培养基对供试菌株的生长有明显的抑制作用。而1％L-半胱氨酸PDA培养基对于供试菌株产生的作用则大不相同，部分菌株生长速度减慢，部分菌株生长速度加快，少数菌株的生长速度几乎没有变化，因此，L-半胱氨酸不能作为鉴定变种的依据。综上所述特征，供试74株河南省小麦全蚀病菌均属于禾顶囊壳小麦变种（Gaeumanomycesgraminisvar．tritici）。利用Rachadwong和王美南设计的针对禾顶囊壳变种的特异性引物对供试菌株进行PCR检测，通过对产生的特异性条带进行观察，结果显示，所有菌株均得到了大小为870bp的DNA片段，与禾顶囊壳小麦变种产生的条带大小一致，并无其他变种的特异性条带出现。利用真菌通用引物ITS4和ITS5针对供试菌株基因组的ITS1-5.8s-ITS2进行PCR扩增，使用MEGA4.1软件对PCR产物的测序结果进行ITS聚类分析，建立系统发育树后，结果显示：本实验的74株供试菌株全部和6株GenBank登录的禾顶囊壳小麦变种代表性菌株聚在了一起，具有很高的同源性，与其他变种的遗传距离相对较远，可以明显的与其他变种区分开来。以上两种分子技术的研究结果与形态学鉴定的结果相符。温室测定74株小麦全蚀病菌菌株对小麦的致病力，结果显示，河南省小麦全蚀病菌菌株之间致病力存在显著性差异，分为强、中、弱三种致病力类型，主要以强，中致病力类型为主，分别占63.89%和29.73%。以平均病情指数为依据，河南省不同地区间的小麦全蚀病菌致病力存在一定的差异，以周口、商丘、漯河等地区菌株的致病力最强，郑州地区菌株的致病力最弱。河南省内同一地区（以开封地区为例）不同小麦全蚀病菌菌株之间的致病力存在极显著性差异。