基于RICE6K芯片的水稻品质相关性状QTL定位

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shenshenxiaomo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
进入新时代,我国水稻生产从“高速增长”阶段进入到“高质量发展”阶段,广大人民的需求从“吃得饱”向“吃的好”转变,优良品质的稻米越来越受消费者欢迎,优质已经成为水稻新品种选育的主要目标之一。近年来,我国科学家们在水稻品质研究中取得重要进展,定位了大量品质QTL,克隆了部分主效基因,并解释了其遗传机理,丰富了稻米品质调控的遗传网络。为了进一步发掘稻米品质微效QTL的遗传效应,发掘更多的基因资源,本研究构建了一个F2分离群体,通过RICE6K芯片检测基因型;考察稻米外观品质、蒸煮与食味品质和部分营养品质等性状,进行遗传连锁作图,定位品质性状QTL,主要结果如下:1.本研究前期收集了529份微核心种质资源,其中Pusa表现出最长粒长表型,两系不育系H2613S具有多个优良性状,杂交获得F1然后自交得到F2分离群体,选择314份F2群体单株为试验材料。利用RICE6K芯片进行基因型分型,并考察群体的外观、蒸煮与食味和部分营养品质,材料间品质表型变异较大,利用连锁分析构建遗传连锁图谱,发掘品质QTL。2.遗传连锁分析结果显示:共检测到54个品质性状相关QTL。其中7个粒长QTL分布在水稻第2、6和7号染色体上;7个粒宽QTL分布在水稻第2、3、4、6、7和9号染色体上;4个长宽比QTL分布在水稻第4、6、7和9号染色体上;6个千粒重QTL分布在水稻第1、2、6、7和9号染色体上;2个垩白度QTL分布在水稻第4和6号染色体上;5个垩白粒率QTL分布在水稻第4、9和10号染色体上;5个透明度QTL分布在第1、2、6和7号染色体上;4个直链淀粉含量QTL分布在水稻第6、9和10号染色体上;1个清蛋白含量QTL位于水稻第7号染色体上;2个球蛋白含量QTL分布在水稻第2和9号染色体上;4个谷蛋白含量QTL分布在水稻第2和6号染色体上;5个糊化温度QTL分布在水稻第3、5、6和8号染色体上;2个胶稠度QTL分布在水稻第6和12号染色体上。效应较大、解释遗传变异率较高的QTLs作为候选QTLs进行后续研究。3.本研究在第7号染色体的标记R072100914-R072761302之间的660kb区间内检测到多个粒型QTL,其中包括一个已克隆的基因GL7/GW7/GL7NR,该基因位点就坐落在区间作图的峰值处。结果表明,利用RICE6K芯片进行连锁作图是一种可行的、有效的鉴定QTL的方法。本研究初步发掘了多个水稻品质相关QTL,通过比较分析,发现部分位点与前人报道位点一致,部分为新发现位点,正在对重点QTL构建近等基因系,进行精细定位,研究结果预期为水稻遗传育种研究提供更多的基因资源和理论基础。
其他文献
CASPARIAN STRIP MEMBRANE DOMAIN PROTEINS(CASPs)是定位于内皮层细胞壁凯氏带区域的四跨膜蛋白,属于一个未鉴定蛋白家族(UPF0497),目前该蛋白家族的功能研究尚未得到深入完整的解析。为了鉴定小麦中的CASP同源蛋白并探究验证其生物学功能,本研究采取生物信息学分析与转基因验证相结合的方法对小麦CASP家族成员进行整体挖掘与功能探究。我们通过家族分析获得小
学位
白菜(Brassica rapa)是一类重要的蔬菜作物,品种类型非常丰富。我国是白菜的起源中心和多样性中心,收集保存了大量的地方品种和改良品种。然而,我们对这些种质资源的遗传多样性及亲缘关系了解有限,存在“同物异名”或“同名异物”的情况,影响了白菜品种资源的保存与应用。虽然现有的单标记检测技术(如SSR、KASP等)能进行种质资源遗传多样性评价和品种亲缘关系分析,但是这些标记技术成本高、通量低。本
学位
意识形态工作从来都是关乎中国共产党的先进性和社会主义前途命运的重要问题。党的十八大以来,习近平总书记高度重视我国意识形态建设工作,围绕新时代如何着力加强我国意识形态工作,作出全面部署,提出一系列新观点,形成了习近平社会主义意识形态重要论述。这一重要论述结合当前时代特征以及中国发展的客观实践,对意识形态理论进行了创新发展,具有鲜明的中国特色。这一理论视野宏远,思想深邃,为党的意识形态工作指明了方向,
学位
茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)所引起的植物细菌性青枯病危害严重防治困难,尤其是对茄科作物如番茄和马铃薯等的生产造成很大损失。青枯菌寄主范围广泛,病菌群体遗传特性复杂,相关的致病因子和寄主适应性还未被充分解析。本实验室从番茄青枯病的样品中分离得到一株强致病力菌株并命名为ES5-1,该菌株能够克服抗病品种H7996的抗病性。分析了ES5-1菌株的生物学特性、寄主范围和遗传
学位
小麦作为全球主要粮食作物,为人类提供了20%以上的热量需求,培育高产、稳产小麦新品种长期以来是主要育种目标。但是小麦产量受多种因素制约,其中条锈病、叶锈病和赤霉病是限制我国小麦安全生产的主要因素,而株高和籽粒性状对小麦高产发挥重要作用。因此,利用分子标记发掘上述表型相关位点,开发有效连锁标记进行基因聚合对小麦品种培育具有重要意义。基于此,本课题开展以下三部分相关研究内容:第一部分,利用HN5290
学位
本文考虑如下的具有不连续激活函数的离散神经网络系统(?),并研究该系统的稳定性,包括它的有界性、非振动性以及渐近性.这里的(Σ)即正文第二章中的(2.1).全文分为四章,各章节主要内容如下:第一章陈述本文的研究背景和课题来源.首先,本章通过几个有代表性的数学模型,对神经网络的历史与发展进行了简要的回顾;接着,介绍了不连续神经网络的研究现状;最后,借鉴前人的研究成果引出本文的研究主题.第二章是本文的
学位
学位
混沌动力学作为动力系统复杂性研究的一个重要课题,已成为近几十年来的一个热门研究领域,并且在实际生活中有广泛的应用.本文主要研究无穷维Fréchet空间上连续线性算子的混沌动力学性质.一方面,探讨线性算子的平均Li-Yorke混沌与分布混沌、Li-Yorke混沌等其他混沌定义之间的关系.另一方面,深入分析一类复合算子的长期渐近行为.具体内容安排如下:第一、二章简要介绍混沌动力系统的研究进展,回顾拓扑
学位
稻虾共作是一种将水稻种植和小龙虾养殖相结合的高效绿色生产方式,随着其在长江中下游的广泛推广,各地区根据当地自然条件因地制宜开展稻田种养,田间结构也出现了多样化的发展。为了比较不同田间结构对温室气体排放的影响,以及不同生境下稻虾共作温室气体排放的差异及影响因素,本研究通过两个试验分别对不同模式和不同地域的稻虾田温室气体排放规律展开研究。试验(一):设置5个处理,试验组为稻虾共作窄沟模式(RC)、宽沟
学位
我国现行的《企业破产法》规定了破产清算、破产重整以及破产和解三种破产程序,其中破产重整程序兼具公平与效率,对于维护社会稳定、挽救危困企业具有重要意义。当法院受理企业破产进入重整程序后,可以由法院指定管理人管理,抑或由债务人向法院申请自行管理,我国债务人自行管理制度源于美国的DIP制度,此制度可以最大限度地调动债务人的重整积极性,激励其发挥管理企业的专业优势,运用人熟、地熟、情况熟的特有优势,推进重
学位