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狂犬病病毒（RABV）为不分节段、单链、反义的RNA病毒，属于弹状病毒科，狂犬病毒属成员，具有典型的嗜神经性。狂犬病病毒感染能引发急性致死性脑脊髓炎。据世界卫生组织（WHO）统计，全球每年死于狂犬病的人数超过55,000人，其中亚洲占56%，非洲占44%。目前，中国的狂犬病发病率仅次于印度，位居世界第二位。严重威胁人类的生命安全，因此，狂犬病的防控形势仍很严峻。尽管狂犬病是一种古老的人兽共患病，RABV也经过数百年来的研究，但是RABV确切的致病机理仍不清楚。从细胞和分子水平研究宿主和病毒相互作用是揭示病毒致病机理的重要途径。近来研究表明， RNA干扰（RNAi）已经成为研究抗病毒固有免疫反应的重要组成部分。miRNA分子的高效表达也在调节宿主-病毒相互作用中发挥重要的作用。但是细胞内miRNA具体是如何发挥机体抗病毒作用的机制仍需进一步研究。大量的研究报告显示，细胞内miRNA能够影响病毒的趋向性、毒力和致病性。细胞内miRNA还能从实质上影响病毒的进化，调节病毒对组织的嗜性等功能。这些miRNA在宿主与病毒相互作用网络中起到至关重要的作用。在RABV与宿主或细胞的相互作用方面，尤其是对RABV感染导致宿主miRNA表达谱变化以及生物学功能改变的了解还存在一定的局限性。miRNA芯片技术可高通量检测数以万计miRNA的表达水平，借助生物信息学方法预测miRNA的靶基因，并对其进行基因表达模式分析、靶基因功能聚类、靶基因作用路径和网络分析以及qRT-PCR和DNA芯片结果的相互验证等，从而高效准确的获得病毒感染过程中的宿主反应的miRNA及其相关信息。表达差异miRNA的靶基因参与多种免疫反应信号通路。miRNA表达谱和mRNA表达谱相互协调，初步阐明了RANB感染后的调节机制，并对研究RABV的致病机理具有重要的意义。本实验中，我们检测了感染RABV街毒株FJDRV和弱毒株ERA的鼠脑脑组织中的miRNA表达谱，并对表达水平显著变化的miRNA进行靶点预测和功能富集。最终，我们通过基因芯片和qPCR验证差异miRNA相关的预测靶点在这些通路中的表达水平。功能性富集显示，这些miRNA的靶点在RABV感染过程中起到重要的作用。本研究主要分为三部分：第一部分：狂犬病病毒弱毒株（ERA）感染小鼠中枢神经系统microRNA表达谱变化。本研究利用microRNA芯片检测了RABV弱毒株感染小鼠后脑组织中的microRNA表达谱变化。结果显示有10个miRNA：miR-1894-5p, miR-290-3p,miR-1901, miR-207, miR-1896, miR-715, miR-3470b, miR-146b, miR-203,miR-770-5p表达水平显著上调，6个miRNA: miR-200a, miR-200b, miR-200c,miR-182, miR-183, miR-429表达水平显著下调。这16个表达差异的miRNA经miRanda、 TargetScan和MicroCosm三种预测软件预测6200个靶基因。利用DAVID进行Gene ontology（GO）分析和KEGG Pathways分析。结果表明差异基因参与JAK-STAT信号转导通路、抗原加工与提呈、泛素介导的蛋白降解和补体活化途径等。本实验提示，在RABV感染过程中，细胞内的miRNA能直接或者间接的调节下游的基因表达。第二部分：狂犬病病毒街毒株（FJDRV）感染小鼠中枢神经系统microRNA表达谱变化。结果显示，有9个miRNA表达水平发生显著的上调，分别是：miR-691、miR-377、miR-1935、miR-190、miR-1902、miR-135α*、miR-203、miR-2138和miR-290-5p。然而只有miR-145表达水平发生显著的下调。表达差异miRNA调节的靶基因经过TargetScan、MicroCosm和miRanda三种数据库进行预测，共预测靶基因数为3038。利用DAVID进行Gene ontology（GO）分析和KEGG Pathways分析。结果表明靶基因参与了多条免疫相关信号通路。如Jak-ATAT信号通路、MAPK信号通路、Fc-γ介导的吞噬作用以及趋化因子和细胞因子受体的相互作用等。本实验表明miRNAs在病毒感染过程中起到重要的作用，细胞内miRNAs表达水平的改变可能与病毒的毒力和致病性有关。第三部分：强弱毒株感染鼠脑microRNA表达谱的比较分析。FJDRV和ERA具有不同的嗜神经性，而且致病力具有显著差异。RABV感染导致一系列miRNA和mRNA表达谱发生变化，并且发现街毒和固定毒诱导截然不同的miRNA和mRNA表达谱。结果表明，小鼠抗病毒免疫功能可能通过ERA感染所诱导的特异性miRNA介导的免疫应答调控网络得到优化，然而，FJDRV却不能。通过分析不同毒株RABV感染后中枢神经系统microRNA表达谱变化,可以加深对RABV致病机理的理解。本研究首次研究RABV颅内感染能引发小鼠脑组织microRNA表达谱变化。miRNA作为机体生理或病理过程的重要调控分子，可能参与了RABV-宿主的相互作用。本研究结果可为探索狂犬病的预防和治疗策略奠定基础。