猪MEF2A基因的克隆及表达规律的研究

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MEF2家族属于MADS超家族,广泛的存在于骨骼肌与心肌细胞中,是最早发现具有肌肉调控特性的DNA结合活性因子。MEF2是肌肉组织发生和发育过程中的重要调控因子,控制脊椎动物肌肉特异基因表达,在肌纤维发育和神经系统发育中都起重要调节作用。基于肌细胞增强子在调控细胞增殖和肌肉分化中的重要作用,进一步揭示其功能和作用机理,有助于更好的理解肌肉组织的发生与发育模式。本研究采用比较基因组学和生物信息学等方法,克隆MEF2A基因并对其结构进行分析;通过构建分子进化树来研究MEF2A基因的系统发育;采用Real time PCR方法,研究了纯种大白猪MEF2A基因不同组织不同发育阶段的表达规律和MEF2家族4个基因的组织表达规律。主要研究结果如下:1.克隆了猪MEF2A基因cDNA序列(Genbank Accession Number:EF576923),基因编码区全长1524 bp,编码508个氨基酸,分子量为50844.98 Da,其结构上存在一个MADS-box的结构域、位于10-243附近。2.对猪MEF2家族基因的4个基因进行多重序列比对,发现一个极高的同源性区域,此处主要为MADS-box区。4个基因的MADS保守结构域同源比对分析,表明MEF2B与MEF2D的MADS-box结构域的同源性最高为100%,MEF2A与MEF2B和MEF2D的MADS-box结构域分化程度最大,同源性为89%。3.基于猪MEF2A基因的cDNA序列,依据Neighbor-Joining算法,构建了9个物种分子进化关系树。4.采用Real time PCR的方法对90、180、270日龄纯种大白猪的MEF2A基因心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、背肌、腿肌10个组织表达量进行了检测:表明MEF2A基因在肌肉组织中表达量较高且稳定,在其他组织中表达量较低,肝中的表达量最低。5.同样方法对90日龄MEF2家族4个基因进行了10个组织的表达量检测,4个基因组织表达上具有共同特征:肌肉组织(背肌、腿肌、心肌)表达量较高,脏腑肌(胃、大肠、小肠)表达量次之,其他组织中表达量较低;同时,也对同一组织中4个基因的表达情况进行了比较。
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