随着世界各国各地区政治、经济、科技等方面的发展,越来越体现出区域化的特征,区域就成为了各项事业发展的载体；而区域要想获得持续的发展动力和较强的竞争优势,就必须在本区域内部,构建和完善具有本地区特色的区域创新系统。区域创新系统,是区域内各创新主体协同作用的有机系统。在这个系统中,各行为主体发挥着不同的作用;特别是政府这一行为主体,凭借其特殊的身份,拥有并发挥着其他创新主体无法实现的系统功能。另外,随着当前我国政府的全面转型,认清地方政府在区域创新系统中的角色,并对政府行为进行全面优化,就成为了确保区域创新系统良性运转的必要条件。由此,本文把区域创新系统中政府行为作为研究的重点,旨在通过各项具体的对策建议,从而达到全面优化政府行为,完善区域创新系统,提高其创新能力,推动区域经济及社会事业协调发展的终极目的。本文首先对国内外区域创新系统中政府行为的有关研究进行梳理和总结,重点阐述了区域创新系统中政府行为的界定、必要性、定位及其行为机制。其次,在此基础之上对现有的区域创新系统中政府行为的评价体系及评价方法做了全面的述评,找出现有指标体系的优势与不足；再次,再根据评价指标遴选的原则与现有文献和理论的支撑,构建出新的区域创新系统中政府行为绩效评价体系,并选取熵权法作为本文的评价模型；之后以四川省为样本区域,对四川省2008-2012年的区域创新中政府行为做出综合评价：一是找出评价体系中权重较高的政府行为指标；二是研究各级评价指标在五年间的变化及趋势；最后,根据以上评价结果,找出四川省政府在构建区域创新系统中的行为存在的问题,并提出相应的优化政府行为的对策和建议。