中日关系是东亚地区最重要的双边关系之一。但是两国长期将彼此视为威胁,互信严重不足,日本大力渲染“中国威胁论”,中国担心“日本军国主义复活”,在军事上,由于领土争端的存在,双方更是彼此防范,陷入了遏制与反遏制的恶性循环中,两国之间存在着较为典型的安全困境。中日安全困境不仅是双边关系发展中的最大障碍,而且由于两国在地区政治经济格局中的重要地位,这也意味着两国的安全困境也会对东亚地区的和平与稳定产生消极影响。缓解两国的安全困境,是中国和平崛起的需要,也是促进地区和平与稳定的必然要求。造成中日安全困境因素包括：有效的地区安全合作机制的缺失、两国之间的重大的安全与战略利益冲突以及双方间长期的互不信任和沟通交流失败。主流国际关系理论中有关安全困境的缓解方式有：合作应对共同威胁、构建国际机制和培育积极认同。非传统安全合作在理论上可以促成三种缓解安全困境方式的实现,即非传统安全合作是应对共同威胁的有效方式、非传统安全合作能够推动国际机制的建立和培育积极认同。落实到缓解中日安全困境的实践中,非传统安全合作通过这三种方式,都能够对缓解中日安全困境产生一定的效力。在应对共同威胁上,非传统安全合作对中日安全困境的缓解效力较为明显,不仅提升了两国的政治互信,还直接推动了两国的传统安全合作；在构建国际机制上,非传统安全合作推动了东亚地区合作机制的建立,这些合作机制增进了两国的沟通交流,为两国增信释疑提供了第三方平台,而且部分合作机制已经出现了向传统安全领域“外溢”的现象,对缓解两国的安全困境具有一定的效力。在培育积极认同上,非传统安全合作一定程度上转变了两国政府和民众间长期的敌对心理,改善了两国的政治关系和民间关系,为两国民众沟通交流开辟了新渠道,有助于两国民众间友好关系的建立,从而为缓解两国安全困境奠定良好的民间基础。总之加强非传统安全合作可以缓解两国的安全困境,但与此同时,两国要注重提升非传统安全合作的机制化水平,使非传统安全合作朝着稳定化和常态化的方向发展；要有意识地加强与传统安全紧密相连的非传统安全领域的合作,将非传统安全合作提升至战略高度,推动非传统安全合作的效应“外溢”至传统安全领域；以提高非传统安全合作对两国安全困境的缓解效力。