乳腺癌患者miRNA综合预后标签的构建及验证

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:niko_robin
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目的:尽管乳腺癌的早期诊断和治疗方法在近些年有较大的进展,但其死亡率仍较高。甚至一些被认为预后良好的Luminal型乳腺癌病人进展也很快。这说明目前乳腺癌的分类标准可能不能完全将其中高危和低危的病人区分开,需要新的分类方法补充现有分类标准。本研究的目的是构建可以预测乳腺癌预后的miRNA标签,以期为乳腺癌的分类和治疗提供新的思路。方法:从TCGA官方网站下载了1098个乳腺癌病人的miRNA测序及其临床病理和随访数据。制定标准来选择合适的病例,并从中筛选出了253个符合标准的病例用于后续的分析。之后用随机的方法,将这253个病人分为训练组(153人)和验证组(100人),使用R软件对训练组进行分析后构建了一个含有3个miRNA的预后标签,随后在验证组内验证其有效性和稳定性,并将253个病例汇总后,根据不同的分类标准进行亚组分析。最后使用寡核苷酸序列在乳腺癌细胞系中探索此标签与乳腺癌细胞增殖,细胞周期和细胞凋亡的关系,进一步验证标签的有效性。结果:R软件的分析结果表明,hsa.mir.31,hsa.mir.16.2,hsa.mir.484等三个miRNA与乳腺癌病人的预后独立相关,其组成的预后标签在预测乳腺癌预后方面具有较高的稳定性和准确性。Hsa.mir.484的高表达与预后不佳相关,而hsa.mir.31和hsa.mir.16.2的高表达则与预后良好相关,危险评分的计算方法为:(0.494×hsa.mir.484表达量)–(0.786×hsa.mir.16.2表达量)–(0.620×hsa.mir.31表达量)。亚组分析的结果显示,此标签可准确预测年龄≤45岁,基底样及激素受体阳性的乳腺癌病人的预后,而对年龄在45岁以上或者Her2过表达类型的乳腺癌预测效果不佳,且此标签的预测效果与患者的AJCC分期无关。之后根据β系数(即hsa.mir.484为危险因素,hsa.mir.31及hsa.mir.16.2为保护因素)进行转染的寡核苷酸实验结果表明,hsa.mir.484+/16.2-/31-组(即“高危”组)与对照组相比,乳腺癌细胞出现增殖加快,凋亡轻度减少,细胞周期激活的现象;而hsa.mir.484-/16.2+/31+组(即“低危组”)则出现增殖减慢,凋亡显著增多,细胞周期停滞的现象。结论:从实验结果可以看出,本研究所构建的3-miRNA标签系统可有效的预测女性乳腺癌的预后,尤其是对基底样和激素受体阳性的年轻女性乳腺癌病人的预测更为准确。根据本研究结果,若病人经评分系统预测属于高危,则建议采用相对激进的治疗手段并适当减少随访间歇期。
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