冰草遗传连锁图谱构建及主要农艺性状的QTL定位

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冰草属(Agropyron Gaertn.)植物为禾本科小麦族多年生异花授粉植物,具有抗逆、丰产等多种优良性状,是小麦的重要野生近缘属之一,可用于小麦的遗传改良。本研究采用以冰草属典型物种蒙古冰草Z2098(母本)和二倍体冰草Z1842(父本)进行人工杂交获得的杂种F1代群体为作图群体,利用EST-SSR、SLAF分子标记构建冰草P基因组的高密度遗传连锁图谱,并对种植于廊坊、昌黎和沽源3个环境下的冰草CP群体的主要农艺性状进行QTL定位,为冰草重要性状基因克隆和分子标记辅助育种等研究奠定基础。结果如下:1.对3个环境下调查的冰草CP群体主要农艺性状进行分析,发现各农艺性状均存在丰富的遗传变异,同一农艺性状在不同地区之间有显著性差异,而不同年份之间则无显著变化。2.利用亲本蒙古冰草Z2098、二倍体冰草Z1842的基因组DNA进行EST-SSR引物筛选,从1076对EST-SSR引物中选出471对多态性EST-SSR引物,对冰草CP群体的133个单株进行PCR扩增,获得31个成功分型的EST-SSR标记,并构建了包含28个EST-SSR标记共7个连锁群的冰草遗传连锁图谱,该图谱全长1?617.73 c M,平均图距57.78 c M。通过卡方检验,有15个EST-SSR分子标记发生偏分离,其中有12个严重偏分离分子标记。3.利用中国农业科学院作物科学研究所提供的56个EST-SSR分子标记以及已经成功构建冰草P基因组遗传连锁图谱的1?023个SLAF分子标记,结合本研究获得的31个EST-SSR分子标记,构建出一张包含64个EST-SSR标记、1?009个SLAF标记共7个连锁群的冰草遗传连锁图谱,该图谱全长674.4c M,平均图距0.63c M。4.利用已构建的高密度的冰草遗传连锁图谱对3个环境下冰草CP群体主要农艺性状进行QTL定位,共检测出252个QTLs,单个QTL的遗传贡献率在0.32%-20.82%之间。其中,在2个环境下均能检测到的QTLs有19个,包含8个主效QTLs,其遗传贡献率在0.37%-13.31%之间。
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