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生防细菌L5分离自扬州郊区土壤中,经测定该菌株抑菌谱广,可抑制番茄灰霉病菌、水稻稻瘟病菌、水稻纹枯病菌、小麦赤霉病菌、油菜菌核病菌和棉花枯萎病菌的生长,虽然该菌株分离自土壤,但对气传病害番茄灰霉病菌有较强的拮抗作用。通过孢子萌发抑制实验、离体叶片和果实生物测定,结果表明菌株L5菌悬液对孢子萌发抑制率达93%,对番茄叶片灰霉病防效达72%,是一株具有潜在生防能力的拮抗细菌。对该菌株的生防相关性状进行分析,结果表明菌株L5可产生抗生素硝吡咯菌素(Pyrrolnitrin)和嗜铁素等抗菌物质,不产生水解酶,蛋白酶。经过16S rDNA序列、16S-23S rDNA间区序列同源性分析和生理生化性状的测定,将该菌株鉴定为气味沙雷氏菌(Serratia odorifera).细菌菌株L5包含2个16S-23S rDNA的间区(IGSs),其中IGS1内含t]RNAGlu基因,IGS类型属于IGSG;IGS2内含tRNAIle和tRNAAla基因,IGS类型属于IGSIA。采用常规PCR和sitefinding PCR法克隆到沙雷氏菌L5部分硝吡咯菌素合成基因簇(prnABCD)5488bp,将测得序列在GenBank上进行比对分析,结果表明与普城沙雷氏菌G3的硝吡咯菌素合成基因簇相似性最高,达到99%。克隆所得的片段包含完整的(?)rnA、prnB、prnC基因和部分prnD基因,序列已经递交到GenBank,登录号为JQ712667。这四个开放阅读框都位于同一个转录单元内,转录方向从prnA—prnD.prnA全长1598bp,起始密码子ATG,终止密码子TAG; prnB基因全长1086bp,与prnA基因终止子直接相连,起始密码子GTG,终止密码子TGA; prnC基因全长1704bp,与prnB基因间隔41bp,起始密码子ATG,终止密码子TAG,比对发现prnC部分在各个菌株中相似性最高,保守型最强;prnD基因长1022bp,与prnC基因间隔24bp,起始密码子ATG,不包括完整开放阅读框。目前气味沙雷氏菌硝吡咯菌素合成基因簇为国际首次报道。