中国是一个典型的城乡二元经济结构的发展中国家,虽然经过了20多年的市场化导向的经济改革,但中国的城乡二元经济结构并没有得到缓解,相反,其还呈不断恶化的趋势。本文对改革开放以来中国的城乡二元经济演变背后的金融因素进行了系统的研究,研究认为,中国的金融制度安排是内生于特定的经济转轨路径,其是由政府由上而下所推行的一项强制性制度安排,其主要目的是为了满足政府给予经济改革中的利益受损集团(主要是国有企业和城市居民)以利益补偿的需要。因此,在这样的内生金融制度安排下的金融资源的配置就具有强烈的政府偏好意愿,导致了金融资源配置的国有企业与城市部门偏好。另一方面,即使不考虑政府偏好而导致的金融资源的扭曲配置,这种内生的金融制度本身所具有的一些特征(包括利率管制、垄断的银行结构和被抑制的农村金融)也必然导致金融资源配置的城市化倾向和农村金融资源的外流。金融资源配置的城市部门偏好和农村金融资源的外流将会通过作用于城乡资本积累和城市就业岗位的创造,以及导致农村信贷约束等多种渠道对城乡二元经济结构产生影响。在理论分析基础上,本文以1996-2004年的省级面板数据为样本,采用一阶差分GMM和System GMM估计法所进行的计量检验结果表明,金融机构信贷规模的扩张是显著的阻碍了农业劳动力转移和拉大了城乡劳动生产率差异,因此,中国的金融制度安排实际上是恶化了城乡二元的经济结构。本文的研究对于中国当前的金融市场化改革和缩小城乡经济差距均具有很强的政策含义,文章的最后是给出了一组相应的政策含义。