紫菜是重要的海洋经济作物，开展紫菜育种方式等基础性研究是国内外藻类学研究者关注的热点之一。随着我国社会经济的发展，传统的贝壳丝状体育苗技术在长期栽培生产过程中，逐渐显露出许多弊端。贝壳丝状体培养周期长，前期的厂房建设、种菜和附着基（贝壳），以及培养过程中的定期换水和贝壳洗刷等，需要消耗大量的土地资源、人力和物力。通过紫菜自由丝状体直接成苗技术代替传统的贝壳丝状体育苗技术，达到省时省力的目的，提高资源利用率。经过几十年对紫菜自由丝状体育苗技术的摸索和研究，已证明该技术具有可行性，不仅已具备一定的理论指导，也能在室外完成采苗工作，但规模很小，还未达到生产应用的要求。同时紫菜丝状体含有大量的藻胆蛋白，可进一步开发成功能食品和海洋药物，具有良好的市场前景和开发潜力。针对这些问题，本论文以坛紫菜自由丝状体为研究材料，通过人工调控培养紫菜自由丝状体，优化坛紫菜自由丝状体工程化育苗技术和研究丝状体新应用，为我国紫菜自由丝状体产业化提供理论依据。现得出以下的结果：　　第一：通气培养下，盐度和光照对紫菜自由丝状体鲜重和光合色素含量变化反映，相同光照下，丝状体SGR在盐度20―40内随盐度的上升而主要呈现先上升后下降的趋势；盐度30时SGR保持较高；盐度40，各光照组SGR较低；高光照下，各盐度组保持较高的SGR；低光照下各盐度组SGR较低。坛紫菜自由丝状体在摇床培养条件下生长较好，SGR可达10.8327﹪-10.8915﹪；摇床培养下的丝状体PE含量相对静置培养的较高点，通气培养的相对较低；静置条件下培养的丝状体PC含量最高，摇床培养次之，通气培养最低。相同培养方式下，换水频率对丝状体SGR影响不大；除通气培养外，换水频率20天其PE、PC含量较高。　　第二：对两种紫菜丝状体摇床培养的动态变化研究表明，藻丝的生长主要表现在藻丝分枝增多、藻丝伸长和藻丝增粗。SGR的变化跟水温基本呈现反向趋势。在0-20天时水温处于21℃左右，丝状体保持较高的SGR，生长速率较快；21-40天内，随着气温的逐渐升高，SGR逐渐下降，生长受到抑制；41-60天内，SGR随着气温的下降先下降后上升。SGR同气温呈现负相关关系。光化合效率和气温呈负相关，并和SGR保持相近趋势。借助48 L鼓泡式光生物反应器，观察了不同疏密绒球状丝状体的生长发育情况，较为疏松的绒球状丝状体分枝较多，液泡较大，色素较淡，细胞长宽比小，并且出现部分较粗的丝状体，体积增加最快，SGR最高为7.1283％，是最低的2.7倍。较为紧密的绒球状丝状体较为细长，分枝少，液泡较大体积增加不明显。　　第三：不同处理方式对自由丝状体藻胆蛋白含量表现出差异性，处理方式为光照和盐度的藻红蛋白、藻蓝蛋白含量波动范围介于25.557±1.719～37.577±1.173、1.681±0.419～4.85±0.084之间，处理方式为培养方式和换水频率的藻红蛋白、藻蓝蛋白含量波动范围介于9.847±7.969～36.817±3.563、1.082±0.387～3.836±0.272之间。培养方式对自由丝状体藻红蛋白、藻蓝蛋白含量显著性影响最大（P=0.0004，P<0.0001），其次是盐度，对自由丝状体丝状体藻红蛋白、藻蓝蛋白含量分别达到极显著、显著水平（P=0.0006，P=0.0199），光照和换水频率则没有显著性差异。表明不同的调控手段对自由丝状体藻胆蛋白含量有较大影响，因而我们可通过优化的培养条件获得高含量的藻胆蛋白。