改革开放三十余年，我国历届中央政府都非常重视农民、农民和农业发展的问题，中央连续九年的一号文件都是出于对这些农业问题的持续关注，充分说明了党中央对农村、农民和农业发展的重视。农民在土地上所获得的收入是其主要经济来源，但是现在农民手中的土地最大的特点就是分散、零碎、规模小。如果大多数农民仅仅靠自己承包的少量土地，因为中国90%的土地只能种植粮食作物，依据其农业的产出来说，农村土地的产出主要是大宗农产品的产出，种植粮食作物的耕地价值不是很高，单单靠这少量土地种植粮食作物的话，那么根本没有办法使自己的生活达到国家所定义的小康水平。如果在我国已有的土地承包经营制度稳定的基础上，通过土地承包经营权的合理合法流转，将农民手中分散、零碎的土地通过流转，集中，形成规模化耕种，也是符合国家一直以来的农村政策。土地是农民生存和发展的根本保障，土地对农民不仅仅意味着收入，而且在现阶段承担了许多应该由国家承担的诸如就业、医疗和养老等对农民的生活保障功能。由于我国目前关于保障农民合法权益的法律与法规并不够完善，甚至在现实的生活中还存在着缺位的现象。而基于行政法的角度来审视此问题，原因主要在于我国对农民合法权益的保障主要以政策层面的宏观保护为主，却忽视了法律方面的有效保护措施。然而，政策只是为法律的发展提供方向，要想真正达到保护农民合法权益的目的，必须将政策提升至法律层面，因此，我国仅从政策方面去重视和保护农民合法权益的这种做法是无法替代法律保护的；也只有将农民合法权益的保护政策纳入国家法律，农民才能真正享受到这项权利，才能真正切实有效的运用法律手段来维护自己的合法权益；其次，针对我国现有的法律法规，有法不依、执行不力的现象还普遍存在，特别对于一些与政府自身利益有所涉及的涉农性法律、法规，由于政府基于自己利益的考量，无法使法律法规发挥其应有的效力。损农、伤农、坑农现象层出不穷，在某些方面或地区甚为严重，这些因素都是制约这土地有效进行流转的障碍。如果没有有效的方法对这些损害和农民息息相关的根本保障权利的因素进行改进，那么农民的合法权益就没有办法得到保障。农民陷入贫困，再就业困难，社会矛盾就会日益加剧，甚至会出现严重的对立，现在在各地出现的农民群体性事件时有发生，就是农民合法权益没有得到保障的后果，如果这样，国家的稳定和发展也势必会受到影响，国家的一些政策也就流于形式，同时也就制约了土地流转的效率。为了更好的提高农民的生活水平，保障农民的合法权益，提高土地流转的效率，促进国家的经济发展，促进国家和社会的和谐稳定。撰写本文，本文统共分为三个部分来阐述。首先在第一部分介绍了土地流转的概念和情况，简要分析了集体土地流转和农民生存权及发展权等保障权益的关系和保障集体土地流转中农民权利的法律基础。其次在第二部分简要阐述了我国目前在保障农民合法权益立法上的所取得的成绩，主要阐述了在这些方面目前还存在的法律规制的缺失和对农民权利保障的缺位。提出这些问题，在第三部分着重对和农民息息相关的就业权、财产权的保护和社会保障权上出现的问题进行解决，对集体土地流转中农民权利保障的理性思考和如何解决法律规制的缺失、农民权利保障的缺位提出一些办法，以期能有效地改进。只有通过法律保障集体土地流转中的农民的生存权和发展权，让农民在土地流转出去以后，对生存生活保障和发展无忧，才能促进土地进行流转。这也是保障土地流转中农民权益的意义。