随着创新型国家概念的提出和创新驱动发展战略的逐步推进,科技管理越来越受到各个领域的重视,而科技管理的核心内容之一就是科技评估,如何建立科学合理的科技评估体系是进行科技评估的重点和难点。根据发达国家经验,开展科技评估工作应该交由具有“第三方”资质的专业科技评估机构来进行,政府只是作为标准制定或者监督者,而在我国,政府部门主导科技评估的全过程,真正能具有“第三方”资质的科技评估机构少之又少,政府开展科技评估工作,无法保证其公正性和客观性。在目前政府转移职能、深化市场改革的趋势下,政府在科技评估中将主要履行科技规划、管理和监督职能,将其它不必要的科技评估职能转移给具有资质的科技社团等“第三方”专业评估机构来承担将是大势所趋。本文首先对国内外关于科技评估的相关理论进行综述,总结了国外科技评估体系建设中值得借鉴的经验以及我国在科技评估体系建设中的实践和探索,界定了“第三方”、科技评估和科技评估体系的概念。其次,明确了科技评估体系建设的重要性,构建了以科技社团为主导的“第三方”的科技评估体系,论述了科技社团具有“第三方”的资格和作为“第三方”开展科技评估的必然性,并阐述了“第三方”为主体的科技评估体系建设的总体思路和制度安排,初步进行了框架设计,制定了评估的流程,并分别明确了政府和科技社团在科技评估体系建设中的职能定位。再次,梳理山东省科技社团近些年来开展的科技评估的基本状况,并对科技社团开展科技评估相关问题的看法的进行分析,构建了科技社团“第三方”评估资质的评价指标体系和模型,通过层次分析法确定指标权重,运用模糊综合评判法对10家科技社团的“第三方”评估资质进行了综合评价。对山东省应用统计学会作为“第三方”评估2014年度山东省基本公共卫生项目进行经典案例分析,为科技社团开展“第三方”科技评估总结了实践经验。最后针对我国科技评估体系建设目前存在的问题,提出了促进科技评估体系建设的对策建议。