政府机构改革历来都是社会关注的焦点。党的十七届二中全会明确提出要“理顺部门职责分工,坚持一件事情原则上由一个部门负责”,“按照精简统一效能的原则和决策权、执行权、监督权既相互制约又相互协调的要求,紧紧围绕职能转变和理顺职责关系,进-步优化政府组织结构,规范机构设置,探索实行职能有机统一的大部门体制,完善行政运行机制”。这是最新一轮政府机构改革核心之所在。中华人民共和国海关作为国家进出境监督管理机关,必然要顺应建设服务政府、责任政府、法治政府的要求,着力转变职能、理顺关系、优化结构、提高效能,做到权责一致、分工合理、决策科学、执行顺畅、监督有力。在此背景下研究中国海关机构改革问题具有十分重要的现实意义。本文回顾了新中国成立以来海关机构的设置情况,根据行政学、管理学的理论,分析了当前海关机构设置存在的主要问题,剖析了导致问题的原因。从响应党中央、国务院的制度安排；确保海关决策、执行、监督相互制约又相互协调；统一把关服务尺度,放松规制,提高行政效率；推行虚拟组织,打造服务型海关等角度,讨论了中国海关深化机构改革,实行大部门体制的必要性。认为在新形势下,中国海关应参照国外海关机构改革的成功经验,结合我国实际情况,实行大部门体制的机构改革,重点解决好整合和优化、协调和控制、监督和问责、分权和外包等大部门机构改革带来的问题。最后提出了海关机构走向大部门的构想,由此有效厘清各级海关的职责,决策、监督、执行层级各司其职,充分发挥各自效能,促进组织运转更加高效,做到真正“耳聪目明(决策、监督)、四肢协调(执行)”,优化监管和服务,搭建好适应现代海关制度的结构框架。