本研究旨在对当前我国医药制造业的技术创新效率进行科学、合理的评价,找出影响因素和存在的问题,探索从根本上提高我国医药制造业技术创新效率的对策。本文主要从以下几个方面展开研究工作:第一、对技术创新、技术创新效率及其影响因素的相关理论、方法及前人研究动态进行了综述,并回顾了我国现有关于医药制造业技术创新的研究,提出了已有研究的不足。第二、从研发投入强度、人力资本素质、市场结构、所有制结构、三资企业比重、政府支持力度、行业成长能力对技术创新效率的作用机制进行了分析,从理论分析出发,提出了七个假设。第三、参考国内外技术创新效率评价指标体系及医药制造业技术创新的实际情况,利用SPSS测算指标间相关程度,剔除重复指标,建立了我国医药制造业技术创新效率评价指标体系,为确保数据的有效性和可比性,对相应指标按不变价格进行换算。第四、运用DEA模型和Malmquist指数方法对我国医药制造业分行业、分地区的技术创新效率进行静态和动态的测度与评价。静态效率测度结果显示:我国医药制造业整体行业规模小,市场集中度低;化学医药制造业受规模效率的影响导致其无效;中部区域受技术效率和规模效率的共同影响导致技术无效;动态效率测度结果显示:我国医药制造业技术创新效率有所提高,但整体水平偏低;大部分地区技术进步变化指数为负数,这反映出医药制造行业处于技术瓶颈期;技术进步变化指数较小、规模效应不显著制约了化学医药制造业技术创新效率水平的提高;中部地区的技术效率和规模效率的降低导致其技术创新效率的降低。第五、在效率评价的基础上,运用面板数据的固定效应模型对我国医药制造业技术创新效率的影响因素进行了实证研究。影响因素的实证研究表明:研发投入强度对技术创新效率具有显著的正向促进作用;高科技人员配置不合理和国有企业比重过高制约了技术创新效率的提高;三资企业对技术创新重视不够导致其对技术创新效率的负相关;市场集中度、政府支持力度、企业成长能力对我国医药制造业技术创新效率的影响并不显著。在前面研究基础之上,为推进我国医药制造业发展,从研发强度、人力资源、规模效应、所有制结构和产业结构等方面提出相应政策和建议。