2010年12月财政部联合卫生部颁布适用于国内独立核算的公立医院的《医院财务制度》和《医院会计制度》,新制度的提出摒弃了1998年医院财务制度与会计制度的不足,对医院预算管理、成本管理、收入支出管理、财务监督等方面做了重新的诠释,顺应了新医改中推行公立医院改革方案的要求,为公立医院财务管理机制的建立提供了更多更新的理论基础。本文正是以新颁布的《医院财务制度》为理论基础对公立医院的财务管理进行研究,对财务管理中预算管理、成本管理及核算、内部控制三大主要内容进行重点探讨。首先,本文在明确选题背景和意义的基础上,对现存国内外财务管理的研究现状进行文献综述,概括公立医院财务管理的理论基础,综合分析在现行医院财务制度下我国公立医院财务管理的现状及财务管理存在问题。其次,在理论基础上,结合2010年新出台的《医院财务制度》,具体分析预算管理、成本管理及核算、内部控制三方面内容,比较新旧医院财务制度中对这三部分的规定,从而发掘新医院财务制度中的突破创新点,分析新制度中预算管理、成本管理及核算、内部控制的改革变化对公立医院整个财务管理体制改革所起的作用,重点剖析新制度在预算管理、成本管理及核算、内部控制三方面还没有解决的微观和宏观问题,以及在以后的施行过程中可能出现的问题。最后,结合公立医院改革试点的实施方案及公立医院自身经营状况,对预算管理、成本核算及管理和内部控制机制的现实操作提出自己的见解,并设计适应公立医院经营发展的改革方案。例如：全面预算进一步完善的措施,全成本核算方法的采用、考核机制的进一步建立及风险导向型内审模式的采用等。使公立医院财务管理体制的建立顺应医药卫生机构改革中对公立医院公益性和社会福利性的定位和改革要求,为建立公立医院“政事分开、管办分开、医药分开”的有效管理体制做出贡献,实现公立医院提高社会效益与经济效益的双赢局面。