基于增强CT图像的下肢骨骼多标签分割方法研究

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计算机辅助诊断是近年来十分热门的研究方向,研究增强CT图像的下肢骨骼多标签分割,不仅可以服务于骨骼三维阅片诊断、骨科手术规划,还可以进行去骨操作,使用在CT血管分析项目中,用于血管显示、定位等需求,有利于发现早期隐蔽的血管病变。但目前对骨分割的研究往往是针对单块或几块骨骼的单标签分割,对完整下肢骨骼进行多标签分割的研究尚很少见。因此决定采用如今在图像分割领域比较热门的卷积神经网络实现全自动的增强CT图像下肢骨骼多标签分割。在图像预处理方面,为了提高骨骼、背景的对比度,进行了阈值截断处理;对图像采用插值算法统一层间距,使相同大小的块取到的信息大体一致;裁剪出立体感兴趣区域避免不必要信息干扰的同时也缩小了图像尺寸,加快了训练效率;采用计算6方向梯度的三维各向异性扩散滤波在保留边缘细节的前提下对图像进行去噪处理。选用能够获取空间位置信息的三维网络进行研究,设计并实现了基于3D U-Net网络的DSC-3DUNet网络。为了解决原始3D U-Net结构较浅,提取特征能力较弱的问题,加深了一层网络结构,增强网络对高级语义特征的提取能力;在每个编码、解码器的双卷积模块后增加sc SE注意力机制模块,在训练过程中动态调节特征权重;在跳跃连接前增添一个卷积操作,给同尺寸的编码特征图和解码特征图赋予不同的权重,使特征融合更为高效。此外,针对下肢训练样本较少的问题,提出一种基于迁移学习思想的训练策略,先令网络在骨CT值相似的头颈数据集中进行一段时间的预训练,再利用得到的预训练模型初始化DSC-3DUNet网络参数。对预测结果进行多模型结果融合、去除小杂点的后处理操作,可以进一步提升最终的分割效果。最后利用Dice系数、精确度、召回率三个指标在测试集全部17套数据上对方法进行了性能评估,通过消融对比实验和横向对比实验证明了所设计方法的有效性。最终方法的平均Dice系数达到0.977,平均精确度达到0.984,平均召回率达到0.972。
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