前列腺癌是发生在前列腺的恶性肿瘤。大多数前列腺癌患者疾病进展缓慢，早期症状不明显，部分患者进展为晚期前列腺癌，发生转移和出现雄激素抵抗现象，严重者威胁到中老年男性的生命健康。对晚期进展性前列腺癌的分选一个前列腺癌的巨大挑战。尽管前列腺癌在欧美等西方国家中是有着很高的发病率，但在亚洲地区(如中国，日本等国家)发病率并不高，而随着中国人口的快速增长和社会经济的发展，前列腺的筛查及诊断水平不断提高，生活方式逐渐西方化和社会老年化的进程加速等因素的影响，我国前列腺癌发病率呈现着快速上升的趋势，同时前列腺癌的年轻化趋势正在显现，使得前列腺癌正逐渐成为严重影响我国男性健康的泌尿系恶性肿瘤。
　　基因表达谱分析是针对信使RNA(mRNA)表达量进行的一种分析，mRNA是一大类RNA分子，它将遗传信息从DNA传递到核糖体，在那里作为蛋白质合成模板并决定基因表达蛋白产物肽链的氨基酸序列。mRNA和蛋白质表达水平之间总体呈正相关。已有很多研究针对前列腺癌的基因表达谱进行分析，探索前列腺癌的发生发展机制，并发现许多致癌基因和预后基因。
　　我们从差异表达和基因网络分析的角度，使用前列腺癌mRNA数据进行基因表达谱分析，数据来源包括我们收集的55例中国前列腺癌石蜡切片样本，TCGA数据库494例前列腺癌样本和GTEx数据库100例前列腺正常组织样本。我们建立了一个管道来进行差异表达分析和WGCNA网络分析，然后进行功能富集分析和模块的生存预后分析。我们针对中国和TCGA共有的差异表达基因，筛选出与肿瘤分期相关联的基因模块，并用这些模块进行多基因的cox回归分析，以便构建一种更广泛应用范围的生存预测模型，并与其他预测模型进行ROC分析比较。
　　我们比较中国和TCGA的基于GTEx正常数据库的差异表达分析结果，并从中比较两者的差异基因GO富集注释，有意思的是，中国前列腺癌的上调基因GO注释结果显示主要改变了细胞粘附功能和免疫细胞，下调的基因主要改变蛋白质的合成和加工途径。而在TCGA前列腺癌中，上调基因主要改变蛋白的合成和加工途径，这与中国下调基因的注释相反，在TCGA样品中，下调的基因主要参与细胞发育系统。WGCNA分析筛选出独立于样本来源的黄色基因模块，该模块集中于细胞周期等功能，黄色模块的top10基因在TCGA的EFS生存数据中均呈现显著性，我们发现黄色模块基因的高表达导致前列腺癌的更快的生化复发。最后我们用黄色模块中的基因进行cox-lasso多基因回归预测模型，筛选出16个基因用来预测TCGA的生化复发，并与Gleason评分，两个已有的预测模型进行ROC拟合效果的比较，预测效果相当。
　　我们的工作表征了中国人群和TCGA西方人群在前列腺癌中的差异，并提出了关于前列腺癌生化复发的16个基因预测模型。这些发现使人们对前列腺癌在人群间的差异有更好的认识，并用一种新的，更稳健的预测模型去预测前列腺人群的生化复发。